Protein–RNA interactions for Protein: P32915

SEC61, Protein transport protein SEC61, yeastyeast

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC61P32915 YKR040CYKR040C 504 nt10.66□□□□□ -0.7
SEC61P32915 SRT1YMR101C 1032 nt10.66□□□□□ -0.7
SEC61P32915 LIP1YMR298W 453 nt10.66□□□□□ -0.7
SEC61P32915 PTK1YKL198C 1989 nt10.65□□□□□ -0.7
SEC61P32915 GAT1YFL021W 1533 nt10.65□□□□□ -0.7
SEC61P32915 YMR187CYMR187C 1296 nt10.65□□□□□ -0.7
SEC61P32915 YPL068CYPL068C 882 nt10.65□□□□□ -0.7
SEC61P32915 RTG3YBL103C 1461 nt10.65□□□□□ -0.7
SEC61P32915 DED1YOR204W 1815 nt10.65□□□□□ -0.71
SEC61P32915 IDP3YNL009W 1263 nt10.64□□□□□ -0.71
SEC61P32915 LPX1YOR084W 1164 nt10.64□□□□□ -0.71
SEC61P32915 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt10.63□□□□□ -0.71
SEC61P32915 YDR029WYDR029W 315 nt10.61□□□□□ -0.71
SEC61P32915 IRC9YJL142C 393 nt10.61□□□□□ -0.71
SEC61P32915 YLR198CYLR198C 360 nt10.61□□□□□ -0.71
SEC61P32915 YOL106WYOL106W 354 nt10.61□□□□□ -0.71
SEC61P32915 VAM3YOR106W 852 nt10.61□□□□□ -0.71
SEC61P32915 YSP3YOR003W 1437 nt10.6□□□□□ -0.71
SEC61P32915 FMP52YER004W 696 nt10.6□□□□□ -0.71
SEC61P32915 FSH1YHR049W 732 nt10.6□□□□□ -0.71
SEC61P32915 JJJ3YJR097W 519 nt10.6□□□□□ -0.71
SEC61P32915 YJR154WYJR154W 1041 nt10.6□□□□□ -0.71
SEC61P32915 YLR407WYLR407W 687 nt10.6□□□□□ -0.71
SEC61P32915 PEX12YMR026C 1200 nt10.6□□□□□ -0.71
SEC61P32915 YDR541CYDR541C 1035 nt10.59□□□□□ -0.71
SEC61P32915 YHR022CYHR022C 771 nt10.59□□□□□ -0.71
SEC61P32915 NMD4YLR363C 657 nt10.59□□□□□ -0.71
SEC61P32915 LCB1YMR296C 1677 nt10.59□□□□□ -0.71
SEC61P32915 PEX22YAL055W 543 nt10.58□□□□□ -0.72
SEC61P32915 PAB1YER165W 1734 nt10.58□□□□□ -0.72
SEC61P32915 ESC2YDR363W 1371 nt10.57□□□□□ -0.72
SEC61P32915 UBC5YDR059C 447 nt10.57□□□□□ -0.72
SEC61P32915 TRM10YOL093W 882 nt10.57□□□□□ -0.72
SEC61P32915 MXR2YCL033C 507 nt10.57□□□□□ -0.72
SEC61P32915 SPC42YKL042W 1092 nt10.56□□□□□ -0.72
SEC61P32915 DID2YKR035W-A 615 nt10.56□□□□□ -0.72
SEC61P32915 DSC2YOL073C 969 nt10.56□□□□□ -0.72
SEC61P32915 MGR3YMR115W 1506 nt10.56□□□□□ -0.72
SEC61P32915 SLI1YGR212W 1407 nt10.56□□□□□ -0.72
SEC61P32915 YDL121CYDL121C 450 nt10.55□□□□□ -0.72
SEC61P32915 MMS21YEL019C 804 nt10.55□□□□□ -0.72
SEC61P32915 MRS3YJL133W 945 nt10.55□□□□□ -0.72
SEC61P32915 YLR118CYLR118C 684 nt10.55□□□□□ -0.72
SEC61P32915 ATG17YLR423C 1254 nt10.55□□□□□ -0.72
SEC61P32915 FMT1YBL013W 1206 nt10.55□□□□□ -0.72
SEC61P32915 LEU2YCL018W 1095 nt10.55□□□□□ -0.72
SEC61P32915 LYS12YIL094C 1116 nt10.54□□□□□ -0.72
SEC61P32915 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt10.53□□□□□ -0.72
SEC61P32915 ISA2YPR067W 558 nt10.53□□□□□ -0.72
SEC61P32915 COX16YJL003W 357 nt10.52□□□□□ -0.73
SEC61P32915 CDA2YLR308W 939 nt10.52□□□□□ -0.73
SEC61P32915 YFL019CYFL019C 354 nt10.51□□□□□ -0.73
SEC61P32915 RRF1YHR038W 693 nt10.51□□□□□ -0.73
SEC61P32915 PCM1YEL058W 1674 nt10.5□□□□□ -0.73
SEC61P32915 YER147C-AYER147C-A 411 nt10.5□□□□□ -0.73
SEC61P32915 SOR2YDL246C 1074 nt10.49□□□□□ -0.73
SEC61P32915 RRP17YDR412W 708 nt10.49□□□□□ -0.73
SEC61P32915 SOR1YJR159W 1074 nt10.49□□□□□ -0.73
SEC61P32915 PCD1YLR151C 1023 nt10.49□□□□□ -0.73
SEC61P32915 BTS1YPL069C 1008 nt10.49□□□□□ -0.73
SEC61P32915 SLZ1YNL196C 897 nt10.48□□□□□ -0.73
SEC61P32915 YNL228WYNL228W 777 nt10.48□□□□□ -0.73
SEC61P32915 DCP1YOL149W 696 nt10.48□□□□□ -0.73
SEC61P32915 ARL3YPL051W 597 nt10.48□□□□□ -0.73
SEC61P32915 SLM4YBR077C 489 nt10.48□□□□□ -0.73
SEC61P32915 YDR220CYDR220C 294 nt10.47□□□□□ -0.73
SEC61P32915 MHO1YJR008W 1017 nt10.47□□□□□ -0.73
SEC61P32915 IBD2YNL164C 1056 nt10.47□□□□□ -0.73
SEC61P32915 YNL171CYNL171C 369 nt10.47□□□□□ -0.73
SEC61P32915 YCL042WYCL042W 360 nt10.47□□□□□ -0.73
SEC61P32915 FRD1YEL047C 1413 nt10.47□□□□□ -0.73
SEC61P32915 NBP2YDR162C 711 nt10.46□□□□□ -0.73
SEC61P32915 RMD5YDR255C 1266 nt10.46□□□□□ -0.73
SEC61P32915 YLR202CYLR202C 327 nt10.46□□□□□ -0.73
SEC61P32915 SWP1YMR149W 861 nt10.46□□□□□ -0.73
SEC61P32915 CWC15YDR163W 528 nt10.45□□□□□ -0.74
SEC61P32915 RPI1YIL119C 1224 nt10.45□□□□□ -0.74
SEC61P32915 PUS5YLR165C 765 nt10.45□□□□□ -0.74
SEC61P32915 GTR1YML121W 933 nt10.45□□□□□ -0.74
SEC61P32915 RPC53YDL150W 1269 nt10.44□□□□□ -0.74
SEC61P32915 ADH2YMR303C 1047 nt10.44□□□□□ -0.74
SEC61P32915 FES1YBR101C 873 nt10.44□□□□□ -0.74
SEC61P32915 GCN5YGR252W 1320 nt10.43□□□□□ -0.74
SEC61P32915 CWP1YKL096W 720 nt10.43□□□□□ -0.74
SEC61P32915 ENT5YDR153C 1236 nt10.42□□□□□ -0.74
SEC61P32915 BMT6YLR063W 1098 nt10.42□□□□□ -0.74
SEC61P32915 SIM1YIL123W 1431 nt10.41□□□□□ -0.74
SEC61P32915 NSA1YGL111W 1392 nt10.41□□□□□ -0.74
SEC61P32915 MCH5YOR306C 1566 nt10.41□□□□□ -0.74
SEC61P32915 RRP1YDR087C 837 nt10.41□□□□□ -0.74
SEC61P32915 ADK2YER170W 678 nt10.41□□□□□ -0.74
SEC61P32915 RAI1YGL246C 1164 nt10.41□□□□□ -0.74
SEC61P32915 MIX17YMR002W 471 nt10.41□□□□□ -0.74
SEC61P32915 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt10.41□□□□□ -0.74
SEC61P32915 LYS4YDR234W 2082 nt10.4□□□□□ -0.74
SEC61P32915 POP6YGR030C 477 nt10.4□□□□□ -0.74
SEC61P32915 ERV41YML067C 1059 nt10.4□□□□□ -0.74
SEC61P32915 UBS1YBR165W 834 nt10.4□□□□□ -0.74
SEC61P32915 SIR2YDL042C 1689 nt10.39□□□□□ -0.75
SEC61P32915 SPO16YHR153C 597 nt10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.9 ms