Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC8A1P32418 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC8A1P32418 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC8A1P32418 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC8A1P32418 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC8A1P32418 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC8A1P32418 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC8A1P32418 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SLC8A1P32418 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC8A1P32418 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC8A1P32418 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC8A1P32418 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC8A1P32418 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC8A1P32418 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC8A1P32418 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC8A1P32418 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC8A1P32418 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC8A1P32418 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC8A1P32418 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SLC8A1P32418 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SLC8A1P32418 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC8A1P32418 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC8A1P32418 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC8A1P32418 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC8A1P32418 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC8A1P32418 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC8A1P32418 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC8A1P32418 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC8A1P32418 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC8A1P32418 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC8A1P32418 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC8A1P32418 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC8A1P32418 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC8A1P32418 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC8A1P32418 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC8A1P32418 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC8A1P32418 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC8A1P32418 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC8A1P32418 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC8A1P32418 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC8A1P32418 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC8A1P32418 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC8A1P32418 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC8A1P32418 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC8A1P32418 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC8A1P32418 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC8A1P32418 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC8A1P32418 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC8A1P32418 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC8A1P32418 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC8A1P32418 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC8A1P32418 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC8A1P32418 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC8A1P32418 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC8A1P32418 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC8A1P32418 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC8A1P32418 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC8A1P32418 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC8A1P32418 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC8A1P32418 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC8A1P32418 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC8A1P32418 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC8A1P32418 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC8A1P32418 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC8A1P32418 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC8A1P32418 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC8A1P32418 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC8A1P32418 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC8A1P32418 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC8A1P32418 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC8A1P32418 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC8A1P32418 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC8A1P32418 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC8A1P32418 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC8A1P32418 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC8A1P32418 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC8A1P32418 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC8A1P32418 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC8A1P32418 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC8A1P32418 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC8A1P32418 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC8A1P32418 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC8A1P32418 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC8A1P32418 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC8A1P32418 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC8A1P32418 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC8A1P32418 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC8A1P32418 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC8A1P32418 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC8A1P32418 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC8A1P32418 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC8A1P32418 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC8A1P32418 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC8A1P32418 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC8A1P32418 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC8A1P32418 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC8A1P32418 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC8A1P32418 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC8A1P32418 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC8A1P32418 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms