Protein–RNA interactions for Protein: P29590

PML, Protein PML, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMLP29590 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PMLP29590 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PMLP29590 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PMLP29590 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PMLP29590 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PMLP29590 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PMLP29590 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PMLP29590 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PMLP29590 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PMLP29590 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PMLP29590 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PMLP29590 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PMLP29590 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PMLP29590 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PMLP29590 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PMLP29590 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PMLP29590 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PMLP29590 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PMLP29590 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PMLP29590 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PMLP29590 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PMLP29590 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PMLP29590 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PMLP29590 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PMLP29590 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PMLP29590 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PMLP29590 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PMLP29590 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PMLP29590 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PMLP29590 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PMLP29590 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PMLP29590 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PMLP29590 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PMLP29590 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PMLP29590 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PMLP29590 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PMLP29590 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PMLP29590 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PMLP29590 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PMLP29590 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PMLP29590 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PMLP29590 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PMLP29590 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PMLP29590 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PMLP29590 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PMLP29590 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PMLP29590 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PMLP29590 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PMLP29590 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PMLP29590 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PMLP29590 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PMLP29590 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PMLP29590 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PMLP29590 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PMLP29590 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PMLP29590 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PMLP29590 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PMLP29590 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PMLP29590 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PMLP29590 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PMLP29590 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PMLP29590 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PMLP29590 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PMLP29590 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PMLP29590 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PMLP29590 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PMLP29590 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PMLP29590 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PMLP29590 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PMLP29590 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PMLP29590 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PMLP29590 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PMLP29590 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PMLP29590 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PMLP29590 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PMLP29590 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PMLP29590 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PMLP29590 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PMLP29590 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PMLP29590 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PMLP29590 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PMLP29590 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PMLP29590 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PMLP29590 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PMLP29590 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PMLP29590 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PMLP29590 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PMLP29590 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PMLP29590 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PMLP29590 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PMLP29590 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PMLP29590 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PMLP29590 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PMLP29590 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PMLP29590 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PMLP29590 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PMLP29590 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PMLP29590 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PMLP29590 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PMLP29590 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms