Protein–RNA interactions for Protein: P23528

CFL1, Cofilin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFL1P23528 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFL1P23528 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFL1P23528 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFL1P23528 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFL1P23528 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFL1P23528 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFL1P23528 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFL1P23528 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFL1P23528 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFL1P23528 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFL1P23528 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CFL1P23528 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFL1P23528 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFL1P23528 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFL1P23528 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CFL1P23528 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFL1P23528 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFL1P23528 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFL1P23528 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFL1P23528 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFL1P23528 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFL1P23528 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFL1P23528 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFL1P23528 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFL1P23528 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFL1P23528 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFL1P23528 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFL1P23528 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFL1P23528 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CFL1P23528 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFL1P23528 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFL1P23528 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFL1P23528 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFL1P23528 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFL1P23528 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFL1P23528 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFL1P23528 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFL1P23528 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFL1P23528 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFL1P23528 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFL1P23528 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFL1P23528 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFL1P23528 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFL1P23528 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFL1P23528 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFL1P23528 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFL1P23528 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFL1P23528 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFL1P23528 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFL1P23528 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFL1P23528 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFL1P23528 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFL1P23528 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFL1P23528 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFL1P23528 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFL1P23528 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFL1P23528 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFL1P23528 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFL1P23528 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFL1P23528 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFL1P23528 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFL1P23528 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFL1P23528 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFL1P23528 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFL1P23528 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFL1P23528 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFL1P23528 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFL1P23528 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFL1P23528 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFL1P23528 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFL1P23528 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFL1P23528 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFL1P23528 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFL1P23528 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFL1P23528 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFL1P23528 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFL1P23528 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFL1P23528 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFL1P23528 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFL1P23528 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFL1P23528 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFL1P23528 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFL1P23528 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFL1P23528 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFL1P23528 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFL1P23528 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFL1P23528 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFL1P23528 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFL1P23528 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFL1P23528 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFL1P23528 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFL1P23528 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFL1P23528 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFL1P23528 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFL1P23528 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFL1P23528 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFL1P23528 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFL1P23528 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFL1P23528 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFL1P23528 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms