Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA1P21709 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA1P21709 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA1P21709 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA1P21709 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA1P21709 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA1P21709 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA1P21709 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA1P21709 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA1P21709 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA1P21709 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA1P21709 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA1P21709 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA1P21709 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA1P21709 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA1P21709 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHA1P21709 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHA1P21709 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHA1P21709 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHA1P21709 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHA1P21709 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA1P21709 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA1P21709 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA1P21709 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA1P21709 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHA1P21709 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA1P21709 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA1P21709 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA1P21709 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA1P21709 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHA1P21709 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHA1P21709 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA1P21709 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA1P21709 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA1P21709 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA1P21709 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA1P21709 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA1P21709 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA1P21709 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA1P21709 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA1P21709 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA1P21709 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA1P21709 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA1P21709 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA1P21709 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA1P21709 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA1P21709 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA1P21709 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA1P21709 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA1P21709 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA1P21709 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA1P21709 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA1P21709 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA1P21709 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA1P21709 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA1P21709 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA1P21709 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA1P21709 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA1P21709 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA1P21709 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA1P21709 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA1P21709 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA1P21709 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA1P21709 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA1P21709 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA1P21709 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA1P21709 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA1P21709 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA1P21709 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA1P21709 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA1P21709 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA1P21709 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA1P21709 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA1P21709 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA1P21709 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA1P21709 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms