Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMB1P20618 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMB1P20618 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMB1P20618 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMB1P20618 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMB1P20618 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMB1P20618 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMB1P20618 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMB1P20618 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMB1P20618 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMB1P20618 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMB1P20618 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMB1P20618 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMB1P20618 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMB1P20618 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMB1P20618 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMB1P20618 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMB1P20618 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMB1P20618 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMB1P20618 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMB1P20618 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMB1P20618 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMB1P20618 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMB1P20618 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMB1P20618 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMB1P20618 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMB1P20618 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB1P20618 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB1P20618 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB1P20618 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMB1P20618 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMB1P20618 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMB1P20618 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMB1P20618 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMB1P20618 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMB1P20618 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMB1P20618 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMB1P20618 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMB1P20618 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMB1P20618 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB1P20618 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB1P20618 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB1P20618 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB1P20618 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB1P20618 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMB1P20618 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMB1P20618 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMB1P20618 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMB1P20618 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB1P20618 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB1P20618 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB1P20618 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB1P20618 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB1P20618 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB1P20618 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB1P20618 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMB1P20618 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMB1P20618 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMB1P20618 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMB1P20618 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMB1P20618 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMB1P20618 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMB1P20618 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMB1P20618 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMB1P20618 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMB1P20618 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMB1P20618 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMB1P20618 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMB1P20618 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMB1P20618 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMB1P20618 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB1P20618 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB1P20618 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB1P20618 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMB1P20618 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMB1P20618 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMB1P20618 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB1P20618 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB1P20618 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB1P20618 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB1P20618 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB1P20618 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB1P20618 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB1P20618 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB1P20618 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMB1P20618 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMB1P20618 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMB1P20618 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMB1P20618 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMB1P20618 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMB1P20618 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMB1P20618 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMB1P20618 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMB1P20618 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMB1P20618 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB1P20618 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB1P20618 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB1P20618 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMB1P20618 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMB1P20618 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms