Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NELFEP18615 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NELFEP18615 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NELFEP18615 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NELFEP18615 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NELFEP18615 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NELFEP18615 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELFEP18615 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELFEP18615 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELFEP18615 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELFEP18615 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NELFEP18615 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NELFEP18615 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NELFEP18615 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NELFEP18615 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NELFEP18615 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NELFEP18615 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NELFEP18615 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NELFEP18615 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NELFEP18615 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NELFEP18615 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NELFEP18615 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NELFEP18615 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NELFEP18615 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NELFEP18615 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NELFEP18615 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NELFEP18615 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NELFEP18615 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NELFEP18615 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NELFEP18615 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NELFEP18615 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NELFEP18615 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NELFEP18615 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NELFEP18615 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NELFEP18615 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NELFEP18615 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NELFEP18615 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NELFEP18615 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NELFEP18615 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NELFEP18615 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NELFEP18615 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NELFEP18615 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NELFEP18615 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NELFEP18615 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NELFEP18615 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NELFEP18615 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NELFEP18615 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NELFEP18615 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NELFEP18615 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NELFEP18615 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NELFEP18615 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NELFEP18615 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NELFEP18615 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NELFEP18615 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NELFEP18615 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NELFEP18615 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NELFEP18615 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NELFEP18615 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NELFEP18615 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NELFEP18615 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NELFEP18615 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NELFEP18615 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NELFEP18615 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NELFEP18615 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NELFEP18615 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NELFEP18615 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NELFEP18615 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NELFEP18615 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NELFEP18615 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NELFEP18615 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NELFEP18615 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NELFEP18615 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NELFEP18615 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NELFEP18615 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NELFEP18615 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NELFEP18615 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NELFEP18615 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NELFEP18615 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NELFEP18615 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NELFEP18615 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NELFEP18615 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NELFEP18615 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NELFEP18615 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NELFEP18615 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NELFEP18615 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NELFEP18615 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NELFEP18615 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NELFEP18615 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NELFEP18615 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NELFEP18615 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NELFEP18615 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NELFEP18615 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NELFEP18615 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NELFEP18615 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NELFEP18615 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NELFEP18615 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NELFEP18615 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NELFEP18615 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NELFEP18615 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NELFEP18615 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms