Protein–RNA interactions for Protein: P16473

TSHR, Thyrotropin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHRP16473 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSHRP16473 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSHRP16473 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSHRP16473 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSHRP16473 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TSHRP16473 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSHRP16473 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSHRP16473 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSHRP16473 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSHRP16473 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSHRP16473 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSHRP16473 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSHRP16473 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSHRP16473 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSHRP16473 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSHRP16473 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSHRP16473 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSHRP16473 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSHRP16473 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSHRP16473 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSHRP16473 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSHRP16473 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSHRP16473 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TSHRP16473 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TSHRP16473 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSHRP16473 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSHRP16473 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSHRP16473 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSHRP16473 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSHRP16473 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSHRP16473 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSHRP16473 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSHRP16473 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSHRP16473 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSHRP16473 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSHRP16473 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSHRP16473 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSHRP16473 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TSHRP16473 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TSHRP16473 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSHRP16473 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSHRP16473 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSHRP16473 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSHRP16473 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSHRP16473 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSHRP16473 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSHRP16473 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSHRP16473 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSHRP16473 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSHRP16473 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSHRP16473 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSHRP16473 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSHRP16473 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSHRP16473 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSHRP16473 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSHRP16473 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSHRP16473 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSHRP16473 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSHRP16473 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSHRP16473 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TSHRP16473 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSHRP16473 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSHRP16473 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSHRP16473 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSHRP16473 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSHRP16473 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSHRP16473 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSHRP16473 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSHRP16473 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSHRP16473 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TSHRP16473 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSHRP16473 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSHRP16473 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TSHRP16473 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSHRP16473 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSHRP16473 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TSHRP16473 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSHRP16473 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSHRP16473 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSHRP16473 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TSHRP16473 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSHRP16473 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TSHRP16473 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSHRP16473 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSHRP16473 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TSHRP16473 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSHRP16473 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSHRP16473 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TSHRP16473 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSHRP16473 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSHRP16473 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TSHRP16473 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSHRP16473 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSHRP16473 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSHRP16473 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSHRP16473 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSHRP16473 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSHRP16473 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSHRP16473 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSHRP16473 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms