Protein–RNA interactions for Protein: P16298

PPP3CB, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CBP16298 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP3CBP16298 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP3CBP16298 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP3CBP16298 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP3CBP16298 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP3CBP16298 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP3CBP16298 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP3CBP16298 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP3CBP16298 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP3CBP16298 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP3CBP16298 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP3CBP16298 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP3CBP16298 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP3CBP16298 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP3CBP16298 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP3CBP16298 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP3CBP16298 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP3CBP16298 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP3CBP16298 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP3CBP16298 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP3CBP16298 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP3CBP16298 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP3CBP16298 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP3CBP16298 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP3CBP16298 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP3CBP16298 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPP3CBP16298 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP3CBP16298 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP3CBP16298 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP3CBP16298 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP3CBP16298 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP3CBP16298 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP3CBP16298 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP3CBP16298 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP3CBP16298 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP3CBP16298 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP3CBP16298 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP3CBP16298 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP3CBP16298 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP3CBP16298 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP3CBP16298 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP3CBP16298 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP3CBP16298 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP3CBP16298 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP3CBP16298 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP3CBP16298 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP3CBP16298 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP3CBP16298 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP3CBP16298 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP3CBP16298 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP3CBP16298 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP3CBP16298 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP3CBP16298 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP3CBP16298 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP3CBP16298 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP3CBP16298 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CBP16298 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CBP16298 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CBP16298 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CBP16298 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CBP16298 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP3CBP16298 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP3CBP16298 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP3CBP16298 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP3CBP16298 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP3CBP16298 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP3CBP16298 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP3CBP16298 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP3CBP16298 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP3CBP16298 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP3CBP16298 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP3CBP16298 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP3CBP16298 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP3CBP16298 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP3CBP16298 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP3CBP16298 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP3CBP16298 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP3CBP16298 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP3CBP16298 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP3CBP16298 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP3CBP16298 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP3CBP16298 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP3CBP16298 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP3CBP16298 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP3CBP16298 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP3CBP16298 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP3CBP16298 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP3CBP16298 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP3CBP16298 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP3CBP16298 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP3CBP16298 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP3CBP16298 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP3CBP16298 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP3CBP16298 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP3CBP16298 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP3CBP16298 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP3CBP16298 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP3CBP16298 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP3CBP16298 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP3CBP16298 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms