Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ITGB4P16144 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ITGB4P16144 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ITGB4P16144 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ITGB4P16144 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ITGB4P16144 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ITGB4P16144 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ITGB4P16144 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
ITGB4P16144 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
ITGB4P16144 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
ITGB4P16144 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ITGB4P16144 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
ITGB4P16144 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
ITGB4P16144 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ITGB4P16144 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ITGB4P16144 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ITGB4P16144 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ITGB4P16144 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ITGB4P16144 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ITGB4P16144 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ITGB4P16144 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
ITGB4P16144 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ITGB4P16144 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ITGB4P16144 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ITGB4P16144 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ITGB4P16144 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ITGB4P16144 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ITGB4P16144 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ITGB4P16144 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ITGB4P16144 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ITGB4P16144 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ITGB4P16144 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ITGB4P16144 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ITGB4P16144 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ITGB4P16144 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ITGB4P16144 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ITGB4P16144 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
ITGB4P16144 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ITGB4P16144 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ITGB4P16144 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ITGB4P16144 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ITGB4P16144 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ITGB4P16144 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ITGB4P16144 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ITGB4P16144 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ITGB4P16144 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ITGB4P16144 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
ITGB4P16144 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
ITGB4P16144 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
ITGB4P16144 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ITGB4P16144 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ITGB4P16144 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
ITGB4P16144 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ITGB4P16144 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ITGB4P16144 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ITGB4P16144 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ITGB4P16144 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ITGB4P16144 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ITGB4P16144 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ITGB4P16144 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
ITGB4P16144 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ITGB4P16144 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ITGB4P16144 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ITGB4P16144 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ITGB4P16144 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ITGB4P16144 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ITGB4P16144 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ITGB4P16144 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ITGB4P16144 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ITGB4P16144 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ITGB4P16144 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ITGB4P16144 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
ITGB4P16144 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
ITGB4P16144 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ITGB4P16144 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ITGB4P16144 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ITGB4P16144 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ITGB4P16144 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ITGB4P16144 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ITGB4P16144 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ITGB4P16144 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ITGB4P16144 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ITGB4P16144 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
ITGB4P16144 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ITGB4P16144 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ITGB4P16144 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ITGB4P16144 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ITGB4P16144 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
ITGB4P16144 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ITGB4P16144 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ITGB4P16144 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ITGB4P16144 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ITGB4P16144 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ITGB4P16144 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ITGB4P16144 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ITGB4P16144 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ITGB4P16144 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ITGB4P16144 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ITGB4P16144 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ITGB4P16144 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms