Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD8BP10966 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD8BP10966 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD8BP10966 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD8BP10966 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD8BP10966 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD8BP10966 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD8BP10966 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD8BP10966 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD8BP10966 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD8BP10966 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD8BP10966 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD8BP10966 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CD8BP10966 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD8BP10966 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD8BP10966 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD8BP10966 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CD8BP10966 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CD8BP10966 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD8BP10966 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD8BP10966 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD8BP10966 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD8BP10966 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CD8BP10966 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD8BP10966 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD8BP10966 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CD8BP10966 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD8BP10966 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD8BP10966 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD8BP10966 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD8BP10966 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD8BP10966 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CD8BP10966 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD8BP10966 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD8BP10966 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD8BP10966 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD8BP10966 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD8BP10966 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD8BP10966 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD8BP10966 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD8BP10966 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD8BP10966 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD8BP10966 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD8BP10966 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD8BP10966 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD8BP10966 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD8BP10966 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD8BP10966 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD8BP10966 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CD8BP10966 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD8BP10966 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD8BP10966 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD8BP10966 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD8BP10966 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD8BP10966 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD8BP10966 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CD8BP10966 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD8BP10966 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD8BP10966 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD8BP10966 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD8BP10966 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD8BP10966 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD8BP10966 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD8BP10966 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD8BP10966 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD8BP10966 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD8BP10966 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD8BP10966 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD8BP10966 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD8BP10966 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD8BP10966 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD8BP10966 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD8BP10966 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD8BP10966 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CD8BP10966 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD8BP10966 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD8BP10966 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CD8BP10966 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CD8BP10966 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD8BP10966 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD8BP10966 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD8BP10966 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD8BP10966 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD8BP10966 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD8BP10966 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CD8BP10966 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD8BP10966 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD8BP10966 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD8BP10966 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD8BP10966 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD8BP10966 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD8BP10966 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD8BP10966 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD8BP10966 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD8BP10966 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD8BP10966 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD8BP10966 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD8BP10966 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD8BP10966 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD8BP10966 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms