Protein–RNA interactions for Protein: P0DMU3

FAM231A/C-like protein LOC102723383, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0DMU3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
P0DMU3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
P0DMU3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
P0DMU3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
P0DMU3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
P0DMU3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
P0DMU3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
P0DMU3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
P0DMU3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
P0DMU3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
P0DMU3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
P0DMU3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
P0DMU3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
P0DMU3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
P0DMU3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
P0DMU3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
P0DMU3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
P0DMU3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
P0DMU3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
P0DMU3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
P0DMU3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
P0DMU3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
P0DMU3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
P0DMU3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
P0DMU3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
P0DMU3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
P0DMU3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
P0DMU3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
P0DMU3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
P0DMU3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
P0DMU3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
P0DMU3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
P0DMU3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
P0DMU3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
P0DMU3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
P0DMU3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
P0DMU3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
P0DMU3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P0DMU3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
P0DMU3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
P0DMU3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
P0DMU3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
P0DMU3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P0DMU3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P0DMU3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P0DMU3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P0DMU3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P0DMU3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
P0DMU3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
P0DMU3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P0DMU3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
P0DMU3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P0DMU3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P0DMU3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P0DMU3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
P0DMU3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P0DMU3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P0DMU3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P0DMU3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P0DMU3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P0DMU3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P0DMU3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P0DMU3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P0DMU3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P0DMU3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P0DMU3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P0DMU3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P0DMU3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P0DMU3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P0DMU3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P0DMU3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P0DMU3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P0DMU3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P0DMU3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P0DMU3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P0DMU3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P0DMU3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
P0DMU3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P0DMU3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
P0DMU3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P0DMU3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P0DMU3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P0DMU3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P0DMU3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P0DMU3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
P0DMU3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
P0DMU3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
P0DMU3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
P0DMU3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
P0DMU3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
P0DMU3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
P0DMU3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P0DMU3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P0DMU3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P0DMU3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P0DMU3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P0DMU3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P0DMU3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P0DMU3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P0DMU3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms