Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
PRR35P0CG20 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRR35P0CG20 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRR35P0CG20 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRR35P0CG20 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRR35P0CG20 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRR35P0CG20 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRR35P0CG20 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRR35P0CG20 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRR35P0CG20 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRR35P0CG20 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRR35P0CG20 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRR35P0CG20 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRR35P0CG20 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRR35P0CG20 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRR35P0CG20 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRR35P0CG20 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRR35P0CG20 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRR35P0CG20 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRR35P0CG20 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRR35P0CG20 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRR35P0CG20 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRR35P0CG20 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRR35P0CG20 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRR35P0CG20 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRR35P0CG20 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRR35P0CG20 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRR35P0CG20 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRR35P0CG20 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRR35P0CG20 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRR35P0CG20 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRR35P0CG20 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRR35P0CG20 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRR35P0CG20 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRR35P0CG20 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRR35P0CG20 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRR35P0CG20 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRR35P0CG20 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRR35P0CG20 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRR35P0CG20 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRR35P0CG20 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRR35P0CG20 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRR35P0CG20 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRR35P0CG20 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRR35P0CG20 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRR35P0CG20 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRR35P0CG20 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRR35P0CG20 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRR35P0CG20 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRR35P0CG20 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRR35P0CG20 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRR35P0CG20 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRR35P0CG20 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRR35P0CG20 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRR35P0CG20 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRR35P0CG20 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRR35P0CG20 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRR35P0CG20 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRR35P0CG20 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRR35P0CG20 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRR35P0CG20 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRR35P0CG20 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR35P0CG20 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR35P0CG20 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR35P0CG20 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRR35P0CG20 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRR35P0CG20 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRR35P0CG20 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRR35P0CG20 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRR35P0CG20 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRR35P0CG20 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRR35P0CG20 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRR35P0CG20 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRR35P0CG20 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRR35P0CG20 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRR35P0CG20 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRR35P0CG20 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRR35P0CG20 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRR35P0CG20 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRR35P0CG20 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRR35P0CG20 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRR35P0CG20 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRR35P0CG20 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRR35P0CG20 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRR35P0CG20 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRR35P0CG20 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRR35P0CG20 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRR35P0CG20 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRR35P0CG20 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRR35P0CG20 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRR35P0CG20 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRR35P0CG20 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRR35P0CG20 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRR35P0CG20 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRR35P0CG20 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRR35P0CG20 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRR35P0CG20 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRR35P0CG20 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRR35P0CG20 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRR35P0CG20 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms