Protein–RNA interactions for Protein: P09228

CST2, Cystatin-SA, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST2P09228 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CST2P09228 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CST2P09228 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CST2P09228 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CST2P09228 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CST2P09228 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CST2P09228 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST2P09228 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST2P09228 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CST2P09228 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CST2P09228 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CST2P09228 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CST2P09228 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CST2P09228 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CST2P09228 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CST2P09228 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CST2P09228 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CST2P09228 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CST2P09228 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CST2P09228 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CST2P09228 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CST2P09228 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CST2P09228 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CST2P09228 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CST2P09228 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CST2P09228 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CST2P09228 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CST2P09228 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CST2P09228 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CST2P09228 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CST2P09228 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CST2P09228 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CST2P09228 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CST2P09228 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CST2P09228 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CST2P09228 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CST2P09228 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CST2P09228 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CST2P09228 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CST2P09228 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CST2P09228 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CST2P09228 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CST2P09228 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CST2P09228 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CST2P09228 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CST2P09228 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CST2P09228 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CST2P09228 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CST2P09228 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CST2P09228 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CST2P09228 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CST2P09228 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CST2P09228 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CST2P09228 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CST2P09228 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CST2P09228 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CST2P09228 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CST2P09228 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CST2P09228 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CST2P09228 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CST2P09228 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CST2P09228 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CST2P09228 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CST2P09228 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CST2P09228 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CST2P09228 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CST2P09228 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CST2P09228 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CST2P09228 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CST2P09228 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CST2P09228 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CST2P09228 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CST2P09228 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CST2P09228 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CST2P09228 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CST2P09228 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CST2P09228 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CST2P09228 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CST2P09228 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CST2P09228 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CST2P09228 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CST2P09228 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CST2P09228 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CST2P09228 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CST2P09228 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CST2P09228 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CST2P09228 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CST2P09228 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CST2P09228 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CST2P09228 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CST2P09228 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CST2P09228 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CST2P09228 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CST2P09228 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CST2P09228 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CST2P09228 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CST2P09228 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CST2P09228 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CST2P09228 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CST2P09228 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms