Protein–RNA interactions for Protein: P04435

TCRB, T-cell receptor beta chain V region CTL-L17, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBP04435 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBP04435 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBP04435 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBP04435 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBP04435 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBP04435 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBP04435 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBP04435 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBP04435 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBP04435 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCRBP04435 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCRBP04435 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCRBP04435 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCRBP04435 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBP04435 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBP04435 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBP04435 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBP04435 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBP04435 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBP04435 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBP04435 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBP04435 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCRBP04435 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCRBP04435 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBP04435 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBP04435 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBP04435 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBP04435 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBP04435 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBP04435 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBP04435 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBP04435 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBP04435 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBP04435 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBP04435 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBP04435 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBP04435 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBP04435 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBP04435 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBP04435 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBP04435 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBP04435 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBP04435 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBP04435 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBP04435 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBP04435 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBP04435 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBP04435 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBP04435 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBP04435 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCRBP04435 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCRBP04435 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCRBP04435 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCRBP04435 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCRBP04435 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBP04435 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBP04435 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCRBP04435 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCRBP04435 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCRBP04435 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCRBP04435 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCRBP04435 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCRBP04435 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCRBP04435 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCRBP04435 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCRBP04435 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCRBP04435 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCRBP04435 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCRBP04435 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCRBP04435 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCRBP04435 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCRBP04435 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCRBP04435 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCRBP04435 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCRBP04435 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCRBP04435 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCRBP04435 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCRBP04435 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCRBP04435 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCRBP04435 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCRBP04435 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCRBP04435 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCRBP04435 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCRBP04435 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCRBP04435 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCRBP04435 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TCRBP04435 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCRBP04435 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCRBP04435 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCRBP04435 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TCRBP04435 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCRBP04435 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCRBP04435 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCRBP04435 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TCRBP04435 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCRBP04435 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCRBP04435 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCRBP04435 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCRBP04435 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCRBP04435 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms