Protein–RNA interactions for Protein: P04435

TCRB, T-cell receptor beta chain V region CTL-L17, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBP04435 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TCRBP04435 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCRBP04435 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCRBP04435 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCRBP04435 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TCRBP04435 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCRBP04435 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCRBP04435 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCRBP04435 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCRBP04435 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCRBP04435 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCRBP04435 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCRBP04435 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCRBP04435 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCRBP04435 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCRBP04435 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCRBP04435 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TCRBP04435 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCRBP04435 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCRBP04435 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCRBP04435 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCRBP04435 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCRBP04435 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCRBP04435 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCRBP04435 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCRBP04435 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCRBP04435 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCRBP04435 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCRBP04435 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCRBP04435 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCRBP04435 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCRBP04435 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCRBP04435 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCRBP04435 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCRBP04435 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCRBP04435 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCRBP04435 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCRBP04435 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCRBP04435 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCRBP04435 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCRBP04435 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCRBP04435 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCRBP04435 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCRBP04435 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCRBP04435 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCRBP04435 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCRBP04435 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCRBP04435 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCRBP04435 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCRBP04435 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCRBP04435 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCRBP04435 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCRBP04435 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCRBP04435 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCRBP04435 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCRBP04435 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCRBP04435 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCRBP04435 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TCRBP04435 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCRBP04435 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCRBP04435 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCRBP04435 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCRBP04435 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCRBP04435 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCRBP04435 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCRBP04435 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCRBP04435 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCRBP04435 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCRBP04435 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCRBP04435 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCRBP04435 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCRBP04435 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCRBP04435 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCRBP04435 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCRBP04435 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCRBP04435 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCRBP04435 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCRBP04435 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCRBP04435 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCRBP04435 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCRBP04435 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCRBP04435 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCRBP04435 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCRBP04435 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCRBP04435 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCRBP04435 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCRBP04435 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCRBP04435 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TCRBP04435 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCRBP04435 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCRBP04435 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCRBP04435 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCRBP04435 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCRBP04435 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCRBP04435 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCRBP04435 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCRBP04435 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCRBP04435 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCRBP04435 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBP04435 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms