Protein–RNA interactions for Protein: P01732

CD8A, T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8AP01732 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD8AP01732 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD8AP01732 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD8AP01732 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD8AP01732 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD8AP01732 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD8AP01732 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD8AP01732 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CD8AP01732 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD8AP01732 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD8AP01732 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD8AP01732 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CD8AP01732 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD8AP01732 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD8AP01732 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD8AP01732 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD8AP01732 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD8AP01732 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD8AP01732 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD8AP01732 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD8AP01732 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD8AP01732 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD8AP01732 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD8AP01732 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD8AP01732 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD8AP01732 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD8AP01732 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD8AP01732 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD8AP01732 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD8AP01732 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD8AP01732 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD8AP01732 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CD8AP01732 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD8AP01732 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD8AP01732 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD8AP01732 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD8AP01732 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD8AP01732 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD8AP01732 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD8AP01732 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD8AP01732 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD8AP01732 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD8AP01732 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD8AP01732 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD8AP01732 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD8AP01732 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD8AP01732 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD8AP01732 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD8AP01732 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD8AP01732 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD8AP01732 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD8AP01732 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD8AP01732 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD8AP01732 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD8AP01732 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD8AP01732 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD8AP01732 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD8AP01732 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD8AP01732 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD8AP01732 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD8AP01732 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD8AP01732 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CD8AP01732 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD8AP01732 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD8AP01732 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD8AP01732 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD8AP01732 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD8AP01732 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD8AP01732 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD8AP01732 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD8AP01732 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD8AP01732 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD8AP01732 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD8AP01732 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD8AP01732 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD8AP01732 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD8AP01732 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD8AP01732 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD8AP01732 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD8AP01732 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD8AP01732 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD8AP01732 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD8AP01732 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD8AP01732 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD8AP01732 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD8AP01732 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD8AP01732 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD8AP01732 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD8AP01732 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD8AP01732 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD8AP01732 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD8AP01732 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD8AP01732 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD8AP01732 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD8AP01732 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD8AP01732 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD8AP01732 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD8AP01732 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD8AP01732 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD8AP01732 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms