Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZIC2O95409 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZIC2O95409 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZIC2O95409 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZIC2O95409 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZIC2O95409 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZIC2O95409 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZIC2O95409 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZIC2O95409 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZIC2O95409 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZIC2O95409 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZIC2O95409 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZIC2O95409 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZIC2O95409 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZIC2O95409 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZIC2O95409 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZIC2O95409 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZIC2O95409 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZIC2O95409 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZIC2O95409 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZIC2O95409 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZIC2O95409 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZIC2O95409 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZIC2O95409 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZIC2O95409 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZIC2O95409 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZIC2O95409 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZIC2O95409 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZIC2O95409 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZIC2O95409 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZIC2O95409 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZIC2O95409 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZIC2O95409 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZIC2O95409 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZIC2O95409 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZIC2O95409 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZIC2O95409 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZIC2O95409 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZIC2O95409 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZIC2O95409 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZIC2O95409 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZIC2O95409 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZIC2O95409 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZIC2O95409 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZIC2O95409 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZIC2O95409 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZIC2O95409 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZIC2O95409 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZIC2O95409 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZIC2O95409 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZIC2O95409 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZIC2O95409 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZIC2O95409 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZIC2O95409 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZIC2O95409 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZIC2O95409 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZIC2O95409 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZIC2O95409 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZIC2O95409 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZIC2O95409 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZIC2O95409 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZIC2O95409 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZIC2O95409 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZIC2O95409 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZIC2O95409 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZIC2O95409 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZIC2O95409 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZIC2O95409 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZIC2O95409 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZIC2O95409 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZIC2O95409 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZIC2O95409 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZIC2O95409 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZIC2O95409 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZIC2O95409 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZIC2O95409 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZIC2O95409 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZIC2O95409 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZIC2O95409 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZIC2O95409 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZIC2O95409 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZIC2O95409 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZIC2O95409 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZIC2O95409 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZIC2O95409 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZIC2O95409 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZIC2O95409 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZIC2O95409 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZIC2O95409 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZIC2O95409 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZIC2O95409 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZIC2O95409 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZIC2O95409 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZIC2O95409 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZIC2O95409 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZIC2O95409 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZIC2O95409 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZIC2O95409 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZIC2O95409 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZIC2O95409 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms