Protein–RNA interactions for Protein: O95096

NKX2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-2O95096 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX2-2O95096 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX2-2O95096 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX2-2O95096 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-2O95096 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-2O95096 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-2O95096 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX2-2O95096 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX2-2O95096 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX2-2O95096 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX2-2O95096 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NKX2-2O95096 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX2-2O95096 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX2-2O95096 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX2-2O95096 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX2-2O95096 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX2-2O95096 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX2-2O95096 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX2-2O95096 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX2-2O95096 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX2-2O95096 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX2-2O95096 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX2-2O95096 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX2-2O95096 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX2-2O95096 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX2-2O95096 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKX2-2O95096 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKX2-2O95096 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKX2-2O95096 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKX2-2O95096 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NKX2-2O95096 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NKX2-2O95096 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NKX2-2O95096 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX2-2O95096 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX2-2O95096 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX2-2O95096 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX2-2O95096 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX2-2O95096 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX2-2O95096 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX2-2O95096 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX2-2O95096 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX2-2O95096 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NKX2-2O95096 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NKX2-2O95096 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX2-2O95096 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX2-2O95096 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX2-2O95096 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX2-2O95096 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX2-2O95096 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX2-2O95096 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX2-2O95096 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX2-2O95096 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX2-2O95096 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX2-2O95096 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX2-2O95096 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX2-2O95096 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX2-2O95096 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX2-2O95096 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX2-2O95096 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX2-2O95096 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX2-2O95096 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX2-2O95096 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX2-2O95096 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX2-2O95096 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX2-2O95096 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX2-2O95096 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX2-2O95096 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX2-2O95096 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX2-2O95096 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX2-2O95096 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX2-2O95096 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX2-2O95096 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX2-2O95096 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX2-2O95096 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKX2-2O95096 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NKX2-2O95096 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms