Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNKO75909 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNKO75909 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNKO75909 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNKO75909 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNKO75909 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNKO75909 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNKO75909 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNKO75909 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNKO75909 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNKO75909 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNKO75909 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNKO75909 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNKO75909 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNKO75909 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNKO75909 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNKO75909 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNKO75909 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNKO75909 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNKO75909 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNKO75909 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNKO75909 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNKO75909 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNKO75909 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNKO75909 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNKO75909 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNKO75909 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNKO75909 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNKO75909 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNKO75909 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNKO75909 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNKO75909 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNKO75909 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNKO75909 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNKO75909 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNKO75909 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNKO75909 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNKO75909 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNKO75909 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNKO75909 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNKO75909 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNKO75909 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNKO75909 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNKO75909 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNKO75909 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNKO75909 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNKO75909 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNKO75909 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNKO75909 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNKO75909 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNKO75909 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNKO75909 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNKO75909 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNKO75909 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNKO75909 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNKO75909 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNKO75909 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNKO75909 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNKO75909 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNKO75909 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNKO75909 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNKO75909 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNKO75909 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNKO75909 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNKO75909 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNKO75909 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNKO75909 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNKO75909 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNKO75909 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNKO75909 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNKO75909 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNKO75909 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNKO75909 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNKO75909 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNKO75909 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNKO75909 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNKO75909 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNKO75909 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNKO75909 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNKO75909 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNKO75909 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNKO75909 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNKO75909 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNKO75909 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNKO75909 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNKO75909 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNKO75909 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNKO75909 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNKO75909 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNKO75909 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNKO75909 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNKO75909 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNKO75909 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNKO75909 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNKO75909 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNKO75909 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNKO75909 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNKO75909 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNKO75909 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNKO75909 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms