Protein–RNA interactions for Protein: O75631

UPK3A, Uroplakin-3a, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3AO75631 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPK3AO75631 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPK3AO75631 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPK3AO75631 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPK3AO75631 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPK3AO75631 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPK3AO75631 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPK3AO75631 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPK3AO75631 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPK3AO75631 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPK3AO75631 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPK3AO75631 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPK3AO75631 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPK3AO75631 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPK3AO75631 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPK3AO75631 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPK3AO75631 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
UPK3AO75631 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPK3AO75631 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPK3AO75631 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPK3AO75631 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPK3AO75631 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UPK3AO75631 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UPK3AO75631 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UPK3AO75631 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UPK3AO75631 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UPK3AO75631 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UPK3AO75631 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UPK3AO75631 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
UPK3AO75631 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UPK3AO75631 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UPK3AO75631 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UPK3AO75631 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPK3AO75631 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPK3AO75631 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPK3AO75631 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPK3AO75631 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPK3AO75631 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPK3AO75631 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPK3AO75631 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPK3AO75631 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPK3AO75631 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPK3AO75631 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPK3AO75631 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPK3AO75631 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPK3AO75631 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPK3AO75631 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPK3AO75631 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPK3AO75631 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UPK3AO75631 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UPK3AO75631 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPK3AO75631 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPK3AO75631 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPK3AO75631 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPK3AO75631 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPK3AO75631 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPK3AO75631 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPK3AO75631 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPK3AO75631 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPK3AO75631 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPK3AO75631 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UPK3AO75631 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPK3AO75631 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPK3AO75631 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPK3AO75631 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPK3AO75631 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPK3AO75631 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPK3AO75631 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPK3AO75631 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPK3AO75631 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPK3AO75631 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPK3AO75631 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPK3AO75631 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPK3AO75631 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UPK3AO75631 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPK3AO75631 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPK3AO75631 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms