Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 ZMIZ2-204ENST00000416856 616 ntTSL 519.67■□□□□ 0.742e-15■■■■■ 294.1
SF3B1O75533 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.332e-15■■■■■ 294.1
SF3B1O75533 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.12e-15■■■■■ 294.1
SF3B1O75533 POLK-216ENST00000514296 1536 ntTSL 514.32□□□□□ -0.122e-15■■■■■ 294.1
SF3B1O75533 CCT2-203ENST00000544368 1728 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.812e-15■■■■■ 294.1
SF3B1O75533 CCT2-208ENST00000550010 1754 ntTSL 59.08□□□□□ -0.962e-15■■■■■ 294.1
SF3B1O75533 CCT2-214ENST00000553169 758 ntTSL 28.67□□□□□ -1.022e-15■■■■■ 294.1
SF3B1O75533 DAAM1-209ENST00000556596 2844 ntTSL 1 (best)7.29□□□□□ -1.242e-15■■■■■ 294.1
SF3B1O75533 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.312e-15■■■■■ 294.1
SF3B1O75533 POLK-206ENST00000505774 565 ntTSL 43.07□□□□□ -1.922e-15■■■■■ 294.1
SF3B1O75533 HSF1-206ENST00000528988 775 ntTSL 328.03■■■□□ 2.087e-25■■■■■ 292.9
SF3B1O75533 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.557e-25■■■■■ 292.9
SF3B1O75533 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.347e-25■■■■■ 292.9
SF3B1O75533 SERTAD2-202ENST00000476805 1068 ntTSL 322.25■■□□□ 1.157e-25■■■■■ 292.9
SF3B1O75533 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 292.9
SF3B1O75533 HSF1-212ENST00000533240 561 ntTSL 514.53□□□□□ -0.087e-25■■■■■ 292.9
SF3B1O75533 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.147e-25■■■■■ 292.9
SF3B1O75533 USP3-212ENST00000559276 554 ntTSL 46.39□□□□□ -1.397e-25■■■■■ 292.9
SF3B1O75533 WDR74-208ENST00000538098 548 ntTSL 419.25■□□□□ 0.678e-48■■■■■ 292.6
SF3B1O75533 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.18□□□□□ -2.068e-48■■■■■ 292.6
SF3B1O75533 RBL1-204ENST00000527999 599 ntTSL 522.82■■□□□ 1.247e-7■■■■■ 286.4
SF3B1O75533 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.894e-7■■■■■ 281.9
SF3B1O75533 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.212e-9■■■■■ 281.9
SF3B1O75533 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.142e-9■■■■■ 281.9
SF3B1O75533 TMEM259-205ENST00000586704 2538 ntTSL 518.37■□□□□ 0.532e-9■■■■■ 281.9
SF3B1O75533 CHTF18-209ENST00000479976 1110 ntTSL 231.29■■■□□ 2.64e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 PPP2CA-201ENST00000231504 564 ntTSL 429.41■■■□□ 2.34e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.244e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.024e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 NLGN2-203ENST00000572893 305 ntTSL 326.69■■□□□ 1.864e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.824e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.824e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 TRIM14-206ENST00000478530 982 ntTSL 525.1■■□□□ 1.614e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.64e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ARMT1-202ENST00000483931 742 ntTSL 324.8■■□□□ 1.564e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.33■■□□□ 1.494e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 CCDC7-206ENST00000476558 1819 ntTSL 223.87■■□□□ 1.414e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.374e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ABCC10-206ENST00000443426 774 ntTSL 223.49■■□□□ 1.354e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.274e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ACAA1-207ENST00000440176 1328 ntTSL 222.77■■□□□ 1.244e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.184e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 HDAC4-209ENST00000487617 819 ntTSL 322.37■■□□□ 1.174e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.124e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 C10orf35-202ENST00000421716 403 ntTSL 222.05■■□□□ 1.124e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.114e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ACAA1-206ENST00000423611 877 ntTSL 321.89■■□□□ 1.14e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ACAA1-204ENST00000418880 737 ntTSL 321.72■■□□□ 1.074e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.064e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 MRPL21-206ENST00000544567 654 ntTSL 321.66■■□□□ 1.064e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 STXBP1-210ENST00000627871 538 ntTSL 321.45■■□□□ 1.024e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 STXBP1-213ENST00000630492 572 ntTSL 521.29■■□□□ 14e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 MYO18A-208ENST00000530557 1118 ntTSL 521.08■□□□□ 0.974e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 HDAC4-212ENST00000495497 849 ntTSL 521.03■□□□□ 0.964e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.844e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 CHTF18-210ENST00000484349 568 ntTSL 320.29■□□□□ 0.844e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 MYO9B-209ENST00000597073 2087 ntTSL 520.27■□□□□ 0.844e-16■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC35B1-202ENST00000435059 910 ntTSL 220.18■□□□□ 0.822e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SEC61A2-209ENST00000441368 691 ntTSL 520.16■□□□□ 0.824e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC35B1-219ENST00000515850 862 ntTSL 520.16■□□□□ 0.822e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC35B1-214ENST00000509781 806 ntTSL 220.12■□□□□ 0.812e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.774e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 CTNS-204ENST00000452111 617 ntTSL 319.66■□□□□ 0.744e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.714e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.714e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.694e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.684e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC35B1-216ENST00000511763 581 ntTSL 319.19■□□□□ 0.662e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.654e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.654e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ABCC10-203ENST00000372515 933 ntTSL 519.12■□□□□ 0.654e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.654e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 CTNS-207ENST00000495445 536 ntTSL 218.9■□□□□ 0.624e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SEC61A2-213ENST00000475268 2183 ntTSL 1 (best)18.9■□□□□ 0.624e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 C10orf35-203ENST00000491890 746 ntTSL 318.73■□□□□ 0.594e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 MYO9B-208ENST00000596942 584 ntTSL 518.69■□□□□ 0.584e-16■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SEC61A2-212ENST00000472221 850 ntTSL 218.47■□□□□ 0.554e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.544e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.544e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.534e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 CLPTM1L-207ENST00000506641 792 ntTSL 518.26■□□□□ 0.514e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 MRPL21-207ENST00000565125 2283 ntTSL 518.24■□□□□ 0.514e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.514e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 MYO9B-213ENST00000598419 544 ntTSL 518.09■□□□□ 0.494e-16■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ACAA1-208ENST00000447223 915 ntTSL 318.03■□□□□ 0.484e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 BRCA2-204ENST00000530893 2011 ntTSL 1 (best)17.81■□□□□ 0.444e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.424e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SH3BP2-228ENST00000515737 2579 ntTSL 217.58■□□□□ 0.44e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.44e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.394e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 CIC-208ENST00000575839 335 ntTSL 517.4■□□□□ 0.384e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.384e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ADARB1-206ENST00000449478 704 ntTSL 517.37■□□□□ 0.374e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.364e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.344e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 TBC1D17-203ENST00000594984 1441 ntTSL 516.91■□□□□ 0.34e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 CTNS-209ENST00000574776 565 ntTSL 416.78■□□□□ 0.284e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SEC61A2-214ENST00000495368 2311 ntTSL 216.69■□□□□ 0.264e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.254e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SH3BP2-225ENST00000513069 866 ntTSL 316.52■□□□□ 0.244e-12■■■■■ 275.7
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