RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421716.1

C10orf35-202, Transcript of Uncharacterized protein C10orf35, humanhuman

TSL 2

Gene C10orf35, Length 403 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf35-202ENST00000421716 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.68■■■■■ 5.54
C10orf35-202ENST00000421716 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.38■■■■■ 4.69
C10orf35-202ENST00000421716 ABCC9O60706 1549 aa44.23■■■■■ 4.67
C10orf35-202ENST00000421716 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.12■■■■■ 4.33
C10orf35-202ENST00000421716 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.04■■■■■ 4.32
C10orf35-202ENST00000421716 NACADO15069 1562 aa41.87■■■■■ 4.29
C10orf35-202ENST00000421716 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.3■■■■■ 4.2
C10orf35-202ENST00000421716 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.29■■■■■ 4.2
C10orf35-202ENST00000421716 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.28■■■■■ 4.2
C10orf35-202ENST00000421716 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
C10orf35-202ENST00000421716 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.2■■■■■ 4.19
C10orf35-202ENST00000421716 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.93■■■■■ 4.14
C10orf35-202ENST00000421716 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.92■■■■■ 4.14
C10orf35-202ENST00000421716 SCRIBQ14160 1630 aa40.64■■■■■ 4.1
C10orf35-202ENST00000421716 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.18■■■■■ 4.02
C10orf35-202ENST00000421716 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.92■■■■□ 3.98
C10orf35-202ENST00000421716 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.88■■■■□ 3.97
C10orf35-202ENST00000421716 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.73■■■■□ 3.95
C10orf35-202ENST00000421716 SMARCA4P51532 1647 aa38.71■■■■□ 3.79
C10orf35-202ENST00000421716 NCAPD3P42695 1498 aa38.64■■■■□ 3.78
C10orf35-202ENST00000421716 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.64■■■■□ 3.78
C10orf35-202ENST00000421716 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.52■■■■□ 3.76
C10orf35-202ENST00000421716 SMARCA2P51531 1590 aa38.51■■■■□ 3.76
C10orf35-202ENST00000421716 HMGXB3Q12766 1538 aa38.38■■■■□ 3.74
C10orf35-202ENST00000421716 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.36■■■■□ 3.73
C10orf35-202ENST00000421716 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.3■■■■□ 3.72
C10orf35-202ENST00000421716 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.22■■■■□ 3.71
C10orf35-202ENST00000421716 ERCC6Q03468 1493 aa38.12■■■■□ 3.69
C10orf35-202ENST00000421716 NESP48681 1621 aa38.11■■■■□ 3.69
C10orf35-202ENST00000421716 WIZO95785 1651 aa37.98■■■■□ 3.67
C10orf35-202ENST00000421716 CUX2O14529 1486 aa37.8■■■■□ 3.64
C10orf35-202ENST00000421716 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.74■■■■□ 3.63
C10orf35-202ENST00000421716 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.65■■■■□ 3.62
C10orf35-202ENST00000421716 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.63■■■■□ 3.61
C10orf35-202ENST00000421716 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
C10orf35-202ENST00000421716 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.54■■■■□ 3.6
C10orf35-202ENST00000421716 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.52■■■■□ 3.6
C10orf35-202ENST00000421716 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.46■■■■□ 3.59
C10orf35-202ENST00000421716 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
C10orf35-202ENST00000421716 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.2■■■■□ 3.55
C10orf35-202ENST00000421716 CFTRP13569 1480 aa37.15■■■■□ 3.54
C10orf35-202ENST00000421716 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.15■■■■□ 3.54
C10orf35-202ENST00000421716 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.14■■■■□ 3.54
C10orf35-202ENST00000421716 WDR62O43379 1518 aa37.07■■■■□ 3.53
C10orf35-202ENST00000421716 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.02■■■■□ 3.52
C10orf35-202ENST00000421716 PRDM2Q13029 1718 aa36.88■■■■□ 3.49
C10orf35-202ENST00000421716 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
C10orf35-202ENST00000421716 TOPBP1Q92547 1522 aa36.49■■■■□ 3.43
C10orf35-202ENST00000421716 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
C10orf35-202ENST00000421716 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
C10orf35-202ENST00000421716 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.36■■■■□ 3.41
C10orf35-202ENST00000421716 IFT140Q96RY7 1462 aa36.35■■■■□ 3.41
C10orf35-202ENST00000421716 ABCC8Q09428 1581 aa36.32■■■■□ 3.4
C10orf35-202ENST00000421716 OSCARQ8IYS5 282 aa36.23■■■■□ 3.39
C10orf35-202ENST00000421716 TRIM41Q8WV44 630 aa36.16■■■■□ 3.38
C10orf35-202ENST00000421716 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
C10orf35-202ENST00000421716 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
C10orf35-202ENST00000421716 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
C10orf35-202ENST00000421716 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.09■■■■□ 3.37
C10orf35-202ENST00000421716 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.08■■■■□ 3.37
C10orf35-202ENST00000421716 CUX1P39880 1505 aa36.02■■■■□ 3.36
C10orf35-202ENST00000421716 SOGA1O94964 1423 aa35.99■■■■□ 3.35
C10orf35-202ENST00000421716 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.98■■■■□ 3.35
C10orf35-202ENST00000421716 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
C10orf35-202ENST00000421716 CHD1O14646 1710 aa35.88■■■■□ 3.34
C10orf35-202ENST00000421716 FBLN2P98095 1184 aa35.87■■■■□ 3.33
C10orf35-202ENST00000421716 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.77■■■■□ 3.32
C10orf35-202ENST00000421716 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.77■■■■□ 3.32
C10orf35-202ENST00000421716 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.77■■■■□ 3.32
C10orf35-202ENST00000421716 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.71■■■■□ 3.31
C10orf35-202ENST00000421716 WDR97A6NE52 1622 aa35.68■■■■□ 3.3
C10orf35-202ENST00000421716 ARHGEF11O15085 1522 aa35.65■■■■□ 3.3
C10orf35-202ENST00000421716 GRIN2BQ13224 1484 aa35.6■■■■□ 3.29
C10orf35-202ENST00000421716 PBRM1Q86U86 1689 aa35.57■■■■□ 3.28
C10orf35-202ENST00000421716 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
C10orf35-202ENST00000421716 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.54■■■■□ 3.28
C10orf35-202ENST00000421716 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.52■■■■□ 3.28
C10orf35-202ENST00000421716 SYNJ1O43426 1573 aa35.52■■■■□ 3.28
C10orf35-202ENST00000421716 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.52■■■■□ 3.28
C10orf35-202ENST00000421716 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.51■■■■□ 3.28
C10orf35-202ENST00000421716 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.49■■■■□ 3.27
C10orf35-202ENST00000421716 TOP2BQ02880 1626 aa35.48■■■■□ 3.27
C10orf35-202ENST00000421716 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.46■■■■□ 3.27
C10orf35-202ENST00000421716 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.45■■■■□ 3.27
C10orf35-202ENST00000421716 SYNJ2O15056 1496 aa35.42■■■■□ 3.26
C10orf35-202ENST00000421716 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.36■■■■□ 3.25
C10orf35-202ENST00000421716 ARAP1Q96P48 1450 aa35.34■■■■□ 3.25
C10orf35-202ENST00000421716 ADAMTS12P58397 1594 aa35.19■■■■□ 3.22
C10orf35-202ENST00000421716 GRIN2AQ12879 1464 aa35.15■■■■□ 3.22
C10orf35-202ENST00000421716 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.07■■■■□ 3.21
C10orf35-202ENST00000421716 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.06■■■■□ 3.2
C10orf35-202ENST00000421716 CEP170Q5SW79 1584 aa35.06■■■■□ 3.2
C10orf35-202ENST00000421716 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
C10orf35-202ENST00000421716 NUP160Q12769 1436 aa34.98■■■■□ 3.19
C10orf35-202ENST00000421716 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.96■■■■□ 3.19
C10orf35-202ENST00000421716 SHROOM2Q13796 1616 aa34.8■■■■□ 3.16
C10orf35-202ENST00000421716 KIF27Q86VH2 1401 aa34.79■■■■□ 3.16
C10orf35-202ENST00000421716 IGF1RP08069 1367 aa34.76■■■■□ 3.16
C10orf35-202ENST00000421716 JPH4Q96JJ6 628 aa34.7■■■■□ 3.15
C10orf35-202ENST00000421716 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
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