RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483931.1

ARMT1-202, Transcript of acidic residue methyltransferase 1, humanhuman

TSL 3

Gene ARMT1, Length 742 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMT1-202ENST00000483931 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.35■■■■■ 6.45
ARMT1-202ENST00000483931 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.24■■■■■ 5.47
ARMT1-202ENST00000483931 ABCC9O60706 1549 aa48.06■■■■■ 5.28
ARMT1-202ENST00000483931 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.33■■■■■ 5.01
ARMT1-202ENST00000483931 NACADO15069 1562 aa46.3■■■■■ 5
ARMT1-202ENST00000483931 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.12■■■■■ 4.97
ARMT1-202ENST00000483931 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.11■■■■■ 4.97
ARMT1-202ENST00000483931 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.1■■■■■ 4.97
ARMT1-202ENST00000483931 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.88■■■■■ 4.94
ARMT1-202ENST00000483931 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.18■■■■■ 4.82
ARMT1-202ENST00000483931 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.89■■■■■ 4.78
ARMT1-202ENST00000483931 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.88■■■■■ 4.78
ARMT1-202ENST00000483931 SCRIBQ14160 1630 aa44.81■■■■■ 4.76
ARMT1-202ENST00000483931 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.57■■■■■ 4.73
ARMT1-202ENST00000483931 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.1■■■■■ 4.65
ARMT1-202ENST00000483931 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
ARMT1-202ENST00000483931 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.51■■■■■ 4.56
ARMT1-202ENST00000483931 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.23■■■■■ 4.51
ARMT1-202ENST00000483931 SMARCA4P51532 1647 aa42.92■■■■■ 4.46
ARMT1-202ENST00000483931 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.91■■■■■ 4.46
ARMT1-202ENST00000483931 NCAPD3P42695 1498 aa42.74■■■■■ 4.43
ARMT1-202ENST00000483931 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.71■■■■■ 4.43
ARMT1-202ENST00000483931 SMARCA2P51531 1590 aa42.69■■■■■ 4.43
ARMT1-202ENST00000483931 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.61■■■■■ 4.41
ARMT1-202ENST00000483931 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.58■■■■■ 4.41
ARMT1-202ENST00000483931 HMGXB3Q12766 1538 aa42.51■■■■■ 4.4
ARMT1-202ENST00000483931 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
ARMT1-202ENST00000483931 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
ARMT1-202ENST00000483931 WIZO95785 1651 aa42.12■■■■■ 4.33
ARMT1-202ENST00000483931 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
ARMT1-202ENST00000483931 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.59■■■■■ 4.25
ARMT1-202ENST00000483931 NESP48681 1621 aa41.58■■■■■ 4.25
ARMT1-202ENST00000483931 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.46■■■■■ 4.23
ARMT1-202ENST00000483931 ERCC6Q03468 1493 aa41.46■■■■■ 4.23
ARMT1-202ENST00000483931 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.32■■■■■ 4.21
ARMT1-202ENST00000483931 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.22■■■■■ 4.19
ARMT1-202ENST00000483931 CFTRP13569 1480 aa41.22■■■■■ 4.19
ARMT1-202ENST00000483931 CUX2O14529 1486 aa41.1■■■■■ 4.17
ARMT1-202ENST00000483931 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.09■■■■■ 4.17
ARMT1-202ENST00000483931 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
ARMT1-202ENST00000483931 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
ARMT1-202ENST00000483931 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.95■■■■■ 4.15
ARMT1-202ENST00000483931 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.91■■■■■ 4.14
ARMT1-202ENST00000483931 PRDM2Q13029 1718 aa40.87■■■■■ 4.13
ARMT1-202ENST00000483931 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.86■■■■■ 4.13
ARMT1-202ENST00000483931 WDR62O43379 1518 aa40.73■■■■■ 4.11
ARMT1-202ENST00000483931 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
ARMT1-202ENST00000483931 ABCC8Q09428 1581 aa40.39■■■■■ 4.06
ARMT1-202ENST00000483931 TOPBP1Q92547 1522 aa40.3■■■■■ 4.04
ARMT1-202ENST00000483931 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.27■■■■■ 4.04
ARMT1-202ENST00000483931 IFT140Q96RY7 1462 aa40.08■■■■■ 4.01
ARMT1-202ENST00000483931 CUX1P39880 1505 aa39.98■■■■□ 3.99
ARMT1-202ENST00000483931 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
ARMT1-202ENST00000483931 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.86■■■■□ 3.97
ARMT1-202ENST00000483931 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.84■■■■□ 3.97
ARMT1-202ENST00000483931 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
ARMT1-202ENST00000483931 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.81■■■■□ 3.96
ARMT1-202ENST00000483931 SOGA1O94964 1423 aa39.8■■■■□ 3.96
ARMT1-202ENST00000483931 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.74■■■■□ 3.95
ARMT1-202ENST00000483931 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.73■■■■□ 3.95
ARMT1-202ENST00000483931 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
ARMT1-202ENST00000483931 TOP2BQ02880 1626 aa39.67■■■■□ 3.94
ARMT1-202ENST00000483931 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.66■■■■□ 3.94
ARMT1-202ENST00000483931 WDR97A6NE52 1622 aa39.65■■■■□ 3.94
ARMT1-202ENST00000483931 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.6■■■■□ 3.93
ARMT1-202ENST00000483931 SYNJ1O43426 1573 aa39.59■■■■□ 3.93
ARMT1-202ENST00000483931 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
ARMT1-202ENST00000483931 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.51■■■■□ 3.92
ARMT1-202ENST00000483931 OSCARQ8IYS5 282 aa39.37■■■■□ 3.89
ARMT1-202ENST00000483931 GRIN2BQ13224 1484 aa39.36■■■■□ 3.89
ARMT1-202ENST00000483931 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.34■■■■□ 3.89
ARMT1-202ENST00000483931 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.32■■■■□ 3.89
ARMT1-202ENST00000483931 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
ARMT1-202ENST00000483931 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.25■■■■□ 3.87
ARMT1-202ENST00000483931 PBRM1Q86U86 1689 aa39.22■■■■□ 3.87
ARMT1-202ENST00000483931 CHD1O14646 1710 aa39.15■■■■□ 3.86
ARMT1-202ENST00000483931 SYNJ2O15056 1496 aa39.1■■■■□ 3.85
ARMT1-202ENST00000483931 FBLN2P98095 1184 aa39.09■■■■□ 3.85
ARMT1-202ENST00000483931 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.05■■■■□ 3.84
ARMT1-202ENST00000483931 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
ARMT1-202ENST00000483931 KIF27Q86VH2 1401 aa38.94■■■■□ 3.82
ARMT1-202ENST00000483931 ADAMTS12P58397 1594 aa38.94■■■■□ 3.82
ARMT1-202ENST00000483931 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.91■■■■□ 3.82
ARMT1-202ENST00000483931 GRIN2AQ12879 1464 aa38.84■■■■□ 3.81
ARMT1-202ENST00000483931 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.8■■■■□ 3.8
ARMT1-202ENST00000483931 TRIM41Q8WV44 630 aa38.78■■■■□ 3.8
ARMT1-202ENST00000483931 IGF1RP08069 1367 aa38.77■■■■□ 3.8
ARMT1-202ENST00000483931 ARHGEF11O15085 1522 aa38.7■■■■□ 3.79
ARMT1-202ENST00000483931 NUP160Q12769 1436 aa38.69■■■■□ 3.78
ARMT1-202ENST00000483931 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.68■■■■□ 3.78
ARMT1-202ENST00000483931 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.68■■■■□ 3.78
ARMT1-202ENST00000483931 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.68■■■■□ 3.78
ARMT1-202ENST00000483931 CUL7Q14999 1698 aa38.68■■■■□ 3.78
ARMT1-202ENST00000483931 CEP170Q5SW79 1584 aa38.61■■■■□ 3.77
ARMT1-202ENST00000483931 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.54■■■■□ 3.76
ARMT1-202ENST00000483931 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.48■■■■□ 3.75
ARMT1-202ENST00000483931 SHROOM2Q13796 1616 aa38.38■■■■□ 3.74
ARMT1-202ENST00000483931 ARAP1Q96P48 1450 aa38.38■■■■□ 3.73
ARMT1-202ENST00000483931 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.33■■■■□ 3.73
ARMT1-202ENST00000483931 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.32■■■■□ 3.72
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