RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.04■■■■□ 3.52
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SH3BP2-225ENST00000513069 ABCC9O60706 1549 aa32.24■■■□□ 2.75
SH3BP2-225ENST00000513069 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.97■■■□□ 2.55
SH3BP2-225ENST00000513069 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.92■■■□□ 2.54
SH3BP2-225ENST00000513069 NACADO15069 1562 aa30.92■■■□□ 2.54
SH3BP2-225ENST00000513069 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
SH3BP2-225ENST00000513069 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.75■■■□□ 2.51
SH3BP2-225ENST00000513069 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.63■■■□□ 2.49
SH3BP2-225ENST00000513069 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.22■■■□□ 2.43
SH3BP2-225ENST00000513069 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.2■■■□□ 2.431e-6■■□□□ 13.4
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SH3BP2-225ENST00000513069 SCRIBQ14160 1630 aa30■■■□□ 2.39
SH3BP2-225ENST00000513069 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.76■■■□□ 2.35
SH3BP2-225ENST00000513069 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.67■■■□□ 2.34
SH3BP2-225ENST00000513069 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
SH3BP2-225ENST00000513069 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.13■■■□□ 2.25
SH3BP2-225ENST00000513069 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.96■■■□□ 2.23
SH3BP2-225ENST00000513069 SMARCA4P51532 1647 aa28.69■■■□□ 2.18
SH3BP2-225ENST00000513069 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
SH3BP2-225ENST00000513069 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BP2-225ENST00000513069 NCAPD3P42695 1498 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP2-225ENST00000513069 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.58■■■□□ 2.17
SH3BP2-225ENST00000513069 SMARCA2P51531 1590 aa28.49■■■□□ 2.15
SH3BP2-225ENST00000513069 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.44■■■□□ 2.14
SH3BP2-225ENST00000513069 HMGXB3Q12766 1538 aa28.38■■■□□ 2.13
SH3BP2-225ENST00000513069 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
SH3BP2-225ENST00000513069 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.12
SH3BP2-225ENST00000513069 WIZO95785 1651 aa28.21■■■□□ 2.11
SH3BP2-225ENST00000513069 NESP48681 1621 aa27.92■■■□□ 2.06
SH3BP2-225ENST00000513069 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
SH3BP2-225ENST00000513069 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.76■■■□□ 2.03
SH3BP2-225ENST00000513069 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.76■■■□□ 2.03
SH3BP2-225ENST00000513069 ERCC6Q03468 1493 aa27.72■■■□□ 2.03
SH3BP2-225ENST00000513069 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.64■■■□□ 2.01
SH3BP2-225ENST00000513069 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.6■■■□□ 2.01
SH3BP2-225ENST00000513069 CFTRP13569 1480 aa27.59■■■□□ 2.01
SH3BP2-225ENST00000513069 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
SH3BP2-225ENST00000513069 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-225ENST00000513069 CUX2O14529 1486 aa27.45■■□□□ 1.99
SH3BP2-225ENST00000513069 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
SH3BP2-225ENST00000513069 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP2-225ENST00000513069 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP2-225ENST00000513069 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP2-225ENST00000513069 WDR62O43379 1518 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-225ENST00000513069 PRDM2Q13029 1718 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-225ENST00000513069 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
SH3BP2-225ENST00000513069 TOPBP1Q92547 1522 aa26.98■■□□□ 1.91
SH3BP2-225ENST00000513069 ABCC8Q09428 1581 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-225ENST00000513069 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-225ENST00000513069 IFT140Q96RY7 1462 aa26.79■■□□□ 1.88
SH3BP2-225ENST00000513069 CUX1P39880 1505 aa26.79■■□□□ 1.88
SH3BP2-225ENST00000513069 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-225ENST00000513069 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-225ENST00000513069 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2-225ENST00000513069 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2-225ENST00000513069 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BP2-225ENST00000513069 SOGA1O94964 1423 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2-225ENST00000513069 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
SH3BP2-225ENST00000513069 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
SH3BP2-225ENST00000513069 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
SH3BP2-225ENST00000513069 SYNJ1O43426 1573 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-225ENST00000513069 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-225ENST00000513069 TOP2BQ02880 1626 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-225ENST00000513069 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-225ENST00000513069 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP2-225ENST00000513069 WDR97A6NE52 1622 aa26.39■■□□□ 1.82
SH3BP2-225ENST00000513069 OSCARQ8IYS5 282 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-225ENST00000513069 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.32■■□□□ 1.8
SH3BP2-225ENST00000513069 GRIN2BQ13224 1484 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP2-225ENST00000513069 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-225ENST00000513069 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-225ENST00000513069 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-225ENST00000513069 FBLN2P98095 1184 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-225ENST00000513069 CHD1O14646 1710 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-225ENST00000513069 PBRM1Q86U86 1689 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-225ENST00000513069 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-225ENST00000513069 SYNJ2O15056 1496 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-225ENST00000513069 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP2-225ENST00000513069 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-225ENST00000513069 KIF27Q86VH2 1401 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-225ENST00000513069 ADAMTS12P58397 1594 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-225ENST00000513069 IGF1RP08069 1367 aa26.01■■□□□ 1.75
SH3BP2-225ENST00000513069 GRIN2AQ12879 1464 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-225ENST00000513069 TRIM41Q8WV44 630 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-225ENST00000513069 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-225ENST00000513069 ARHGEF11O15085 1522 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-225ENST00000513069 NUP160Q12769 1436 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-225ENST00000513069 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-225ENST00000513069 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-225ENST00000513069 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-225ENST00000513069 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-225ENST00000513069 CEP170Q5SW79 1584 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-225ENST00000513069 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2-225ENST00000513069 CUL7Q14999 1698 aa25.77■■□□□ 1.72
SH3BP2-225ENST00000513069 ARAP1Q96P48 1450 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP2-225ENST00000513069 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP2-225ENST00000513069 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.72■■□□□ 1.71
SH3BP2-225ENST00000513069 JPH4Q96JJ6 628 aa25.67■■□□□ 1.7
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