Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SRPX2O60687 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRPX2O60687 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRPX2O60687 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPX2O60687 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPX2O60687 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPX2O60687 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPX2O60687 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPX2O60687 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPX2O60687 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPX2O60687 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPX2O60687 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPX2O60687 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPX2O60687 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPX2O60687 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPX2O60687 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPX2O60687 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPX2O60687 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPX2O60687 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPX2O60687 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPX2O60687 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPX2O60687 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPX2O60687 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPX2O60687 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRPX2O60687 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRPX2O60687 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRPX2O60687 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRPX2O60687 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRPX2O60687 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRPX2O60687 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPX2O60687 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPX2O60687 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPX2O60687 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPX2O60687 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPX2O60687 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPX2O60687 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPX2O60687 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPX2O60687 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRPX2O60687 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRPX2O60687 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRPX2O60687 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRPX2O60687 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPX2O60687 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPX2O60687 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPX2O60687 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPX2O60687 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPX2O60687 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPX2O60687 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPX2O60687 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPX2O60687 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPX2O60687 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRPX2O60687 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRPX2O60687 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRPX2O60687 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPX2O60687 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRPX2O60687 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRPX2O60687 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRPX2O60687 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRPX2O60687 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPX2O60687 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPX2O60687 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPX2O60687 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPX2O60687 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRPX2O60687 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRPX2O60687 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRPX2O60687 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPX2O60687 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPX2O60687 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPX2O60687 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPX2O60687 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPX2O60687 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPX2O60687 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPX2O60687 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPX2O60687 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPX2O60687 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPX2O60687 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms