Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUSD5O60279 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUSD5O60279 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUSD5O60279 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD5O60279 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD5O60279 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD5O60279 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD5O60279 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD5O60279 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD5O60279 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD5O60279 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD5O60279 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD5O60279 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUSD5O60279 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUSD5O60279 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUSD5O60279 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUSD5O60279 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUSD5O60279 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD5O60279 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUSD5O60279 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUSD5O60279 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUSD5O60279 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUSD5O60279 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUSD5O60279 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD5O60279 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD5O60279 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD5O60279 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD5O60279 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD5O60279 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD5O60279 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD5O60279 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD5O60279 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD5O60279 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD5O60279 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD5O60279 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD5O60279 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD5O60279 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD5O60279 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD5O60279 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD5O60279 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD5O60279 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD5O60279 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD5O60279 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD5O60279 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD5O60279 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD5O60279 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD5O60279 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD5O60279 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD5O60279 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD5O60279 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD5O60279 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD5O60279 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD5O60279 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD5O60279 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD5O60279 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD5O60279 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD5O60279 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD5O60279 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD5O60279 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD5O60279 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD5O60279 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD5O60279 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD5O60279 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD5O60279 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD5O60279 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD5O60279 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD5O60279 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD5O60279 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD5O60279 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD5O60279 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD5O60279 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD5O60279 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD5O60279 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD5O60279 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD5O60279 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD5O60279 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD5O60279 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD5O60279 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD5O60279 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD5O60279 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD5O60279 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD5O60279 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD5O60279 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD5O60279 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD5O60279 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD5O60279 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD5O60279 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD5O60279 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD5O60279 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD5O60279 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD5O60279 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD5O60279 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD5O60279 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD5O60279 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD5O60279 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD5O60279 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD5O60279 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD5O60279 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD5O60279 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD5O60279 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms