Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC28A2O43868 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC28A2O43868 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC28A2O43868 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC28A2O43868 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC28A2O43868 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC28A2O43868 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC28A2O43868 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC28A2O43868 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC28A2O43868 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC28A2O43868 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC28A2O43868 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC28A2O43868 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC28A2O43868 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC28A2O43868 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC28A2O43868 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC28A2O43868 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC28A2O43868 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC28A2O43868 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC28A2O43868 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC28A2O43868 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC28A2O43868 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC28A2O43868 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC28A2O43868 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC28A2O43868 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC28A2O43868 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC28A2O43868 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC28A2O43868 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC28A2O43868 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC28A2O43868 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC28A2O43868 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC28A2O43868 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC28A2O43868 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC28A2O43868 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC28A2O43868 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC28A2O43868 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC28A2O43868 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC28A2O43868 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC28A2O43868 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC28A2O43868 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC28A2O43868 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC28A2O43868 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC28A2O43868 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC28A2O43868 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC28A2O43868 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC28A2O43868 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC28A2O43868 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC28A2O43868 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC28A2O43868 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC28A2O43868 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC28A2O43868 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC28A2O43868 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC28A2O43868 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC28A2O43868 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC28A2O43868 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC28A2O43868 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC28A2O43868 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC28A2O43868 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC28A2O43868 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC28A2O43868 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC28A2O43868 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC28A2O43868 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC28A2O43868 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC28A2O43868 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC28A2O43868 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC28A2O43868 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC28A2O43868 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC28A2O43868 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC28A2O43868 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC28A2O43868 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC28A2O43868 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC28A2O43868 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC28A2O43868 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC28A2O43868 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC28A2O43868 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC28A2O43868 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC28A2O43868 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC28A2O43868 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC28A2O43868 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC28A2O43868 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC28A2O43868 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC28A2O43868 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC28A2O43868 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC28A2O43868 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC28A2O43868 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC28A2O43868 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC28A2O43868 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC28A2O43868 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC28A2O43868 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC28A2O43868 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC28A2O43868 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC28A2O43868 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC28A2O43868 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC28A2O43868 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC28A2O43868 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC28A2O43868 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC28A2O43868 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC28A2O43868 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC28A2O43868 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC28A2O43868 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms