Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BUD23O43709 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BUD23O43709 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BUD23O43709 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BUD23O43709 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BUD23O43709 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BUD23O43709 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BUD23O43709 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BUD23O43709 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BUD23O43709 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BUD23O43709 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BUD23O43709 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BUD23O43709 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BUD23O43709 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BUD23O43709 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BUD23O43709 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BUD23O43709 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BUD23O43709 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BUD23O43709 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BUD23O43709 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BUD23O43709 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BUD23O43709 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BUD23O43709 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BUD23O43709 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BUD23O43709 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BUD23O43709 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BUD23O43709 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BUD23O43709 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BUD23O43709 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BUD23O43709 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BUD23O43709 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BUD23O43709 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BUD23O43709 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BUD23O43709 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BUD23O43709 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BUD23O43709 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BUD23O43709 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BUD23O43709 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BUD23O43709 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BUD23O43709 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BUD23O43709 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BUD23O43709 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BUD23O43709 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BUD23O43709 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BUD23O43709 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BUD23O43709 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BUD23O43709 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BUD23O43709 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BUD23O43709 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BUD23O43709 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BUD23O43709 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BUD23O43709 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BUD23O43709 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BUD23O43709 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BUD23O43709 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BUD23O43709 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BUD23O43709 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BUD23O43709 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BUD23O43709 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BUD23O43709 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BUD23O43709 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BUD23O43709 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BUD23O43709 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BUD23O43709 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BUD23O43709 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BUD23O43709 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BUD23O43709 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BUD23O43709 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
BUD23O43709 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BUD23O43709 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BUD23O43709 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
BUD23O43709 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BUD23O43709 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
BUD23O43709 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BUD23O43709 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BUD23O43709 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BUD23O43709 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BUD23O43709 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BUD23O43709 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BUD23O43709 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BUD23O43709 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BUD23O43709 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BUD23O43709 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BUD23O43709 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BUD23O43709 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BUD23O43709 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BUD23O43709 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BUD23O43709 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BUD23O43709 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BUD23O43709 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BUD23O43709 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BUD23O43709 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BUD23O43709 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BUD23O43709 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BUD23O43709 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BUD23O43709 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BUD23O43709 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BUD23O43709 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BUD23O43709 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BUD23O43709 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms