Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLF4O43474 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLF4O43474 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLF4O43474 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLF4O43474 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLF4O43474 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLF4O43474 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLF4O43474 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLF4O43474 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLF4O43474 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLF4O43474 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLF4O43474 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLF4O43474 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLF4O43474 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLF4O43474 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KLF4O43474 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLF4O43474 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLF4O43474 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLF4O43474 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLF4O43474 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLF4O43474 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLF4O43474 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLF4O43474 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLF4O43474 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLF4O43474 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLF4O43474 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KLF4O43474 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLF4O43474 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLF4O43474 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLF4O43474 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLF4O43474 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLF4O43474 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLF4O43474 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLF4O43474 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLF4O43474 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLF4O43474 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLF4O43474 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLF4O43474 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLF4O43474 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLF4O43474 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLF4O43474 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLF4O43474 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLF4O43474 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLF4O43474 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLF4O43474 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLF4O43474 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLF4O43474 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KLF4O43474 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLF4O43474 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KLF4O43474 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLF4O43474 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLF4O43474 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLF4O43474 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLF4O43474 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLF4O43474 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLF4O43474 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLF4O43474 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLF4O43474 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF4O43474 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLF4O43474 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLF4O43474 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLF4O43474 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLF4O43474 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLF4O43474 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLF4O43474 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLF4O43474 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLF4O43474 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLF4O43474 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLF4O43474 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLF4O43474 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLF4O43474 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLF4O43474 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLF4O43474 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLF4O43474 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLF4O43474 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KLF4O43474 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLF4O43474 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLF4O43474 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLF4O43474 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLF4O43474 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLF4O43474 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLF4O43474 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLF4O43474 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLF4O43474 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KLF4O43474 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLF4O43474 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLF4O43474 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLF4O43474 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLF4O43474 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLF4O43474 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLF4O43474 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLF4O43474 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLF4O43474 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLF4O43474 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLF4O43474 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLF4O43474 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLF4O43474 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLF4O43474 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLF4O43474 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLF4O43474 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms