Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DCLK1O15075 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DCLK1O15075 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DCLK1O15075 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DCLK1O15075 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DCLK1O15075 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DCLK1O15075 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DCLK1O15075 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DCLK1O15075 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DCLK1O15075 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DCLK1O15075 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DCLK1O15075 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCLK1O15075 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCLK1O15075 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCLK1O15075 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DCLK1O15075 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DCLK1O15075 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DCLK1O15075 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
DCLK1O15075 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DCLK1O15075 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DCLK1O15075 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DCLK1O15075 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCLK1O15075 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCLK1O15075 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCLK1O15075 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCLK1O15075 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCLK1O15075 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCLK1O15075 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCLK1O15075 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCLK1O15075 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCLK1O15075 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DCLK1O15075 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DCLK1O15075 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DCLK1O15075 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DCLK1O15075 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
DCLK1O15075 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DCLK1O15075 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DCLK1O15075 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DCLK1O15075 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DCLK1O15075 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DCLK1O15075 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DCLK1O15075 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DCLK1O15075 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DCLK1O15075 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DCLK1O15075 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DCLK1O15075 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DCLK1O15075 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DCLK1O15075 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DCLK1O15075 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DCLK1O15075 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms