Protein–RNA interactions for Protein: O00629

KPNA4, Importin subunit alpha-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA4O00629 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KPNA4O00629 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KPNA4O00629 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KPNA4O00629 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KPNA4O00629 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KPNA4O00629 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KPNA4O00629 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KPNA4O00629 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KPNA4O00629 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KPNA4O00629 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KPNA4O00629 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KPNA4O00629 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KPNA4O00629 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KPNA4O00629 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KPNA4O00629 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KPNA4O00629 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KPNA4O00629 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KPNA4O00629 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KPNA4O00629 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KPNA4O00629 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KPNA4O00629 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KPNA4O00629 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KPNA4O00629 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KPNA4O00629 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KPNA4O00629 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KPNA4O00629 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KPNA4O00629 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KPNA4O00629 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KPNA4O00629 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KPNA4O00629 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KPNA4O00629 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KPNA4O00629 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KPNA4O00629 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KPNA4O00629 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KPNA4O00629 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KPNA4O00629 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KPNA4O00629 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KPNA4O00629 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KPNA4O00629 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KPNA4O00629 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KPNA4O00629 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KPNA4O00629 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KPNA4O00629 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KPNA4O00629 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KPNA4O00629 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KPNA4O00629 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA4O00629 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KPNA4O00629 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KPNA4O00629 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KPNA4O00629 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KPNA4O00629 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KPNA4O00629 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KPNA4O00629 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KPNA4O00629 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KPNA4O00629 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KPNA4O00629 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KPNA4O00629 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KPNA4O00629 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA4O00629 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA4O00629 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA4O00629 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA4O00629 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA4O00629 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA4O00629 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA4O00629 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA4O00629 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA4O00629 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA4O00629 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA4O00629 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA4O00629 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA4O00629 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA4O00629 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA4O00629 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA4O00629 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA4O00629 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA4O00629 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KPNA4O00629 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KPNA4O00629 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KPNA4O00629 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KPNA4O00629 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KPNA4O00629 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KPNA4O00629 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KPNA4O00629 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KPNA4O00629 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KPNA4O00629 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KPNA4O00629 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KPNA4O00629 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KPNA4O00629 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KPNA4O00629 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KPNA4O00629 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KPNA4O00629 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KPNA4O00629 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KPNA4O00629 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KPNA4O00629 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KPNA4O00629 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KPNA4O00629 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KPNA4O00629 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KPNA4O00629 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KPNA4O00629 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KPNA4O00629 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms