Protein–RNA interactions for Protein: E9PQX1

TMEM262, Transmembrane protein 262, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM262E9PQX1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM262E9PQX1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM262E9PQX1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM262E9PQX1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM262E9PQX1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM262E9PQX1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM262E9PQX1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM262E9PQX1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM262E9PQX1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM262E9PQX1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM262E9PQX1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM262E9PQX1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM262E9PQX1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM262E9PQX1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM262E9PQX1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM262E9PQX1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM262E9PQX1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM262E9PQX1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM262E9PQX1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM262E9PQX1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM262E9PQX1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM262E9PQX1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM262E9PQX1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM262E9PQX1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM262E9PQX1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM262E9PQX1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM262E9PQX1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM262E9PQX1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM262E9PQX1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM262E9PQX1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM262E9PQX1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM262E9PQX1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM262E9PQX1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM262E9PQX1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM262E9PQX1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM262E9PQX1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM262E9PQX1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM262E9PQX1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM262E9PQX1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM262E9PQX1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM262E9PQX1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM262E9PQX1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM262E9PQX1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM262E9PQX1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM262E9PQX1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM262E9PQX1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM262E9PQX1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM262E9PQX1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM262E9PQX1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM262E9PQX1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM262E9PQX1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM262E9PQX1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM262E9PQX1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM262E9PQX1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM262E9PQX1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM262E9PQX1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM262E9PQX1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM262E9PQX1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM262E9PQX1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM262E9PQX1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM262E9PQX1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM262E9PQX1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM262E9PQX1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM262E9PQX1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM262E9PQX1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM262E9PQX1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM262E9PQX1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM262E9PQX1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM262E9PQX1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM262E9PQX1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM262E9PQX1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM262E9PQX1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM262E9PQX1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM262E9PQX1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM262E9PQX1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM262E9PQX1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM262E9PQX1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms