Protein–RNA interactions for Protein: A8MTB9

CEACAM18, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 18, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM18A8MTB9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CEACAM18A8MTB9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEACAM18A8MTB9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEACAM18A8MTB9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEACAM18A8MTB9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEACAM18A8MTB9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEACAM18A8MTB9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEACAM18A8MTB9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEACAM18A8MTB9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEACAM18A8MTB9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEACAM18A8MTB9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEACAM18A8MTB9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEACAM18A8MTB9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CEACAM18A8MTB9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CEACAM18A8MTB9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEACAM18A8MTB9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEACAM18A8MTB9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CEACAM18A8MTB9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEACAM18A8MTB9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEACAM18A8MTB9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEACAM18A8MTB9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEACAM18A8MTB9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEACAM18A8MTB9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEACAM18A8MTB9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEACAM18A8MTB9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEACAM18A8MTB9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEACAM18A8MTB9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEACAM18A8MTB9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEACAM18A8MTB9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM18A8MTB9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM18A8MTB9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM18A8MTB9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM18A8MTB9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM18A8MTB9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM18A8MTB9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM18A8MTB9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM18A8MTB9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM18A8MTB9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM18A8MTB9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM18A8MTB9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM18A8MTB9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM18A8MTB9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM18A8MTB9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM18A8MTB9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM18A8MTB9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM18A8MTB9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM18A8MTB9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM18A8MTB9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM18A8MTB9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM18A8MTB9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM18A8MTB9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM18A8MTB9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM18A8MTB9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM18A8MTB9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM18A8MTB9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM18A8MTB9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM18A8MTB9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM18A8MTB9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEACAM18A8MTB9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEACAM18A8MTB9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CEACAM18A8MTB9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEACAM18A8MTB9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEACAM18A8MTB9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEACAM18A8MTB9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEACAM18A8MTB9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEACAM18A8MTB9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CEACAM18A8MTB9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM18A8MTB9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM18A8MTB9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM18A8MTB9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM18A8MTB9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM18A8MTB9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM18A8MTB9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM18A8MTB9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM18A8MTB9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM18A8MTB9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM18A8MTB9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM18A8MTB9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM18A8MTB9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM18A8MTB9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM18A8MTB9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM18A8MTB9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM18A8MTB9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM18A8MTB9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM18A8MTB9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM18A8MTB9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM18A8MTB9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM18A8MTB9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM18A8MTB9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM18A8MTB9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM18A8MTB9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM18A8MTB9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM18A8MTB9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM18A8MTB9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM18A8MTB9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM18A8MTB9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM18A8MTB9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM18A8MTB9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM18A8MTB9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM18A8MTB9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms