Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC66A2RUB6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC66A2RUB6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC66A2RUB6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC66A2RUB6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC66A2RUB6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC66A2RUB6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC66A2RUB6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC66A2RUB6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC66A2RUB6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC66A2RUB6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC66A2RUB6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC66A2RUB6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC66A2RUB6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC66A2RUB6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC66A2RUB6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC66A2RUB6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC66A2RUB6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC66A2RUB6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC66A2RUB6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC66A2RUB6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC66A2RUB6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC66A2RUB6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC66A2RUB6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC66A2RUB6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC66A2RUB6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC66A2RUB6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC66A2RUB6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC66A2RUB6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC66A2RUB6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC66A2RUB6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC66A2RUB6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC66A2RUB6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC66A2RUB6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC66A2RUB6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC66A2RUB6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC66A2RUB6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC66A2RUB6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC66A2RUB6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC66A2RUB6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC66A2RUB6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC66A2RUB6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC66A2RUB6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC66A2RUB6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC66A2RUB6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC66A2RUB6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC66A2RUB6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC66A2RUB6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC66A2RUB6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC66A2RUB6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC66A2RUB6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC66A2RUB6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC66A2RUB6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC66A2RUB6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC66A2RUB6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC66A2RUB6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC66A2RUB6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC66A2RUB6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC66A2RUB6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC66A2RUB6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC66A2RUB6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC66A2RUB6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC66A2RUB6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC66A2RUB6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC66A2RUB6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC66A2RUB6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC66A2RUB6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC66A2RUB6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC66A2RUB6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC66A2RUB6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC66A2RUB6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC66A2RUB6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC66A2RUB6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC66A2RUB6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC66A2RUB6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC66A2RUB6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC66A2RUB6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC66A2RUB6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC66A2RUB6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC66A2RUB6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC66A2RUB6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC66A2RUB6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC66A2RUB6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC66A2RUB6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC66A2RUB6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC66A2RUB6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC66A2RUB6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC66A2RUB6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC66A2RUB6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC66A2RUB6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC66A2RUB6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC66A2RUB6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC66A2RUB6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC66A2RUB6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC66A2RUB6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC66A2RUB6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC66A2RUB6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC66A2RUB6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC66A2RUB6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC66A2RUB6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms