Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQE9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQE9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQE9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQE9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQE9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQE9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQE9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQE9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQE9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQE9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQE9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQE9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQE9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQE9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQE9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQE9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQE9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQE9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQE9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQE9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQE9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQE9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQE9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQE9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQE9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
U3KQE9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
U3KQE9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
U3KQE9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
U3KQE9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
U3KQE9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
U3KQE9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQE9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQE9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQE9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQE9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQE9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQE9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQE9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQE9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQE9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQE9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQE9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQE9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQE9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQE9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQE9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQE9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQE9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQE9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQE9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQE9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQE9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQE9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQE9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQE9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQE9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQE9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16■□□□□ 0.15
U3KQE9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQE9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQE9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
U3KQE9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQE9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQE9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQE9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQE9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQE9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQE9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQE9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQE9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQE9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQE9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQE9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQE9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQE9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQE9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQE9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQE9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQE9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQE9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQE9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQE9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQE9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQE9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQE9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQE9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQE9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQE9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQE9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQE9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQE9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQE9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQE9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQE9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQE9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQE9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQE9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQE9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQE9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQE9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms