Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSD3Q9NYI0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSD3Q9NYI0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSD3Q9NYI0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSD3Q9NYI0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSD3Q9NYI0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSD3Q9NYI0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSD3Q9NYI0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms