Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 XPO6-202ENST00000561488 638 ntTSL 217■□□□□ 0.312e-6■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 NPRL3-206ENST00000464069 551 ntTSL 216.39■□□□□ 0.216e-9■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 ALDOC-208ENST00000582381 571 ntTSL 216.04■□□□□ 0.164e-8■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 RNF187-202ENST00000482739 2467 ntTSL 515.92■□□□□ 0.142e-6■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 DCUN1D2-206ENST00000465710 460 ntTSL 315.83■□□□□ 0.122e-6■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 ALDOC-207ENST00000581807 580 ntTSL 314.86□□□□□ -0.034e-8■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 ALDOC-202ENST00000395319 1519 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.044e-8■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 XPO6-205ENST00000564337 605 ntTSL 514.59□□□□□ -0.072e-6■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 ALDOC-203ENST00000395321 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.164e-8■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 PTP4A2-211ENST00000528840 456 ntTSL 213.98□□□□□ -0.173e-7■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 TXNDC16-201ENST00000281741 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.242e-6■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 ERCC1-204ENST00000423698 3119 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.254e-8■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 XPO6-208ENST00000565698 4255 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.32e-6■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 PTP4A2-216ENST00000534796 900 ntTSL 313.05□□□□□ -0.323e-7■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 DCUN1D2-202ENST00000375403 3164 ntTSL 212.59□□□□□ -0.392e-6■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 PTP4A2-204ENST00000475464 366 ntTSL 312.53□□□□□ -0.43e-7■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 HSPA9-208ENST00000507115 663 ntTSL 311.65□□□□□ -0.541e-15■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 DCUN1D2-204ENST00000439909 562 ntTSL 511.42□□□□□ -0.582e-6■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 PTP4A2-208ENST00000524384 663 ntTSL 510.01□□□□□ -0.813e-7■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 XPO6-210ENST00000566175 248 ntTSL 37.55□□□□□ -1.22e-6■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 HSPA9-203ENST00000504810 584 ntTSL 37.46□□□□□ -1.221e-15■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 PTP4A2-202ENST00000468531 830 ntTSL 37.44□□□□□ -1.223e-7■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 PTP4A2-207ENST00000494444 678 ntTSL 54.72□□□□□ -1.653e-7■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 RBM14-208ENST00000496694 562 ntTSL 58.28□□□□□ -1.089e-7■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.47e-7■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.097e-7■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 ALDH1A2-207ENST00000558231 1664 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.377e-7■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 ALDH1A2-202ENST00000347587 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.447e-7■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 ALDH1A2-224ENST00000561070 554 ntTSL 411.92□□□□□ -0.57e-7■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 ALDH1A2-215ENST00000559266 545 ntTSL 411.85□□□□□ -0.517e-7■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 ALDH1A2-217ENST00000559517 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.617e-7■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 ALDH1A2-203ENST00000430119 3049 ntTSL 211.1□□□□□ -0.637e-7■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.3□□□□□ -2.361e-323■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.43□□□□□ -1.543e-15■□□□□ 10.3
AATFQ9NY61 ISYNA1-204ENST00000577916 2148 ntTSL 527.94■■■□□ 2.069e-7■□□□□ 10.2
AATFQ9NY61 ISYNA1-213ENST00000583534 629 ntTSL 1 (best)24.96■■□□□ 1.599e-7■□□□□ 10.2
AATFQ9NY61 ISYNA1-211ENST00000582811 2039 ntTSL 224.69■■□□□ 1.549e-7■□□□□ 10.2
AATFQ9NY61 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.449e-7■□□□□ 10.2
AATFQ9NY61 ISYNA1-205ENST00000578352 592 ntTSL 223.13■■□□□ 1.299e-7■□□□□ 10.2
AATFQ9NY61 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.939e-7■□□□□ 10.2
AATFQ9NY61 ISYNA1-210ENST00000582770 1654 ntTSL 220.53■□□□□ 0.889e-7■□□□□ 10.2
AATFQ9NY61 ISYNA1-208ENST00000581800 627 ntTSL 419.48■□□□□ 0.719e-7■□□□□ 10.2
AATFQ9NY61 ISYNA1-203ENST00000577820 1466 ntTSL 517.33■□□□□ 0.379e-7■□□□□ 10.2
AATFQ9NY61 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.381e-10■□□□□ 10.2
AATFQ9NY61 RPS16-201ENST00000251453 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.11e-10■□□□□ 10.2
AATFQ9NY61 RPS16-206ENST00000601390 2389 ntTSL 212.96□□□□□ -0.331e-10■□□□□ 10.2
AATFQ9NY61 RPS16-207ENST00000601655 492 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.451e-10■□□□□ 10.2
AATFQ9NY61 RPS16-204ENST00000599539 555 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.491e-10■□□□□ 10.2
AATFQ9NY61 TAF1D-213ENST00000529900 1066 ntTSL 22.25□□□□□ -2.051e-323■□□□□ 10.2
AATFQ9NY61 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.431e-323■□□□□ 10.2
AATFQ9NY61 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.652e-10■□□□□ 10.2
AATFQ9NY61 SETD2-203ENST00000412450 4231 ntTSL 213.19□□□□□ -0.33e-22■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.383e-22■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.694e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 LSS-206ENST00000464357 1041 ntTSL 525.41■■□□□ 1.664e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 LSS-204ENST00000450351 853 ntTSL 521.99■■□□□ 1.114e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.574e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.454e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 PRDX2-203ENST00000466174 1717 ntTSL 1 (best)17.13■□□□□ 0.334e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 SCAF4-206ENST00000485790 1282 ntTSL 216.82■□□□□ 0.284e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.254e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.234e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.24e-6■□□□□ 10.1
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AATFQ9NY61 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.014e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 GRIPAP1-203ENST00000474512 904 ntTSL 214.68□□□□□ -0.064e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 GRIPAP1-201ENST00000376423 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.074e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.124e-6■□□□□ 10.1
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AATFQ9NY61 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.154e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 PRDX2-201ENST00000301522 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.214e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 DUXAP9-205ENST00000619938 642 ntTSL 1 (best)13.45□□□□□ -0.264e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 DUXAP9-203ENST00000610585 903 ntTSL 313.25□□□□□ -0.294e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 GRIPAP1-202ENST00000473581 3278 ntTSL 212.59□□□□□ -0.394e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 GRIPAP1-209ENST00000611757 3255 ntTSL 211.84□□□□□ -0.514e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 SCAF4-203ENST00000434667 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.544e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 CD46-214ENST00000480003 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.564e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 HOOK2-213ENST00000589765 108 ntTSL 510.88□□□□□ -0.674e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 CD46-202ENST00000322918 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.694e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.894e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.894e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.914e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.934e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.014e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.014e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.014e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.024e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 CD46-212ENST00000469535 7826 ntTSL 1 (best)7.99□□□□□ -1.134e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.194e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 DUXAP9-207ENST00000621361 2397 ntTSL 1 (best)6.99□□□□□ -1.294e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 CD46-217ENST00000493796 408 ntTSL 53.22□□□□□ -1.894e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.498e-76■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.262e-7■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.22e-7■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 GPX4-209ENST00000593032 583 ntTSL 322.34■■□□□ 1.172e-7■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.132e-7■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.992e-7■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.62e-7■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 SQSTM1-215ENST00000514093 842 ntTSL 525.06■■□□□ 1.61e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.291e-6■□□□□ 10.1
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