Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms