Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.321e-10■■■■■ 62.5
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TBRG4Q969Z0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 62.3
TBRG4Q969Z0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 62.1
TBRG4Q969Z0 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 62.1
TBRG4Q969Z0 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 62.1
TBRG4Q969Z0 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 62.1
TBRG4Q969Z0 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 62.1
TBRG4Q969Z0 ATE1-204ENST00000423243 2031 ntTSL 1 (best)11□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 62.1
TBRG4Q969Z0 AC025283.2-202ENST00000575785 560 ntTSL 410.9□□□□□ -0.668e-7■■■■■ 62.1
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TBRG4Q969Z0 PRKCZ-210ENST00000470596 788 ntTSL 220.62■□□□□ 0.898e-8■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 SMCO4-203ENST00000526869 374 ntTSL 1 (best)20.47■□□□□ 0.878e-8■■■■■ 61.9
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TBRG4Q969Z0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.538e-8■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 CBFA2T3-206ENST00000563920 1815 ntTSL 217.33■□□□□ 0.368e-8■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 AP4M1-207ENST00000438383 1091 ntTSL 517.21■□□□□ 0.358e-8■■■■■ 61.9
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TBRG4Q969Z0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.238e-8■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.228e-8■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 ZBTB7B-205ENST00000483226 243 ntTSL 316.11■□□□□ 0.178e-8■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.078e-8■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 PRKCZ-222ENST00000496325 563 ntTSL 415.49■□□□□ 0.078e-8■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 AGER-212ENST00000484849 1597 ntTSL 1 (best)15.4■□□□□ 0.068e-8■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 AGER-202ENST00000375056 715 ntTSL 215.38■□□□□ 0.058e-8■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.038e-8■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.018e-8■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.018e-8■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.018e-8■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 PRKCZ-221ENST00000495347 698 ntTSL 414.82□□□□□ -0.048e-8■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.048e-8■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 AGER-209ENST00000450110 716 ntTSL 314.49□□□□□ -0.098e-8■■■■■ 61.9
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TBRG4Q969Z0 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.118e-8■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.128e-8■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.128e-8■■■■■ 61.9
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TBRG4Q969Z0 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.158e-8■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.188e-8■■■■■ 61.9
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TBRG4Q969Z0 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.148e-8■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 DNAH1-204ENST00000486752 13300 ntTSL 27.34□□□□□ -1.248e-8■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 CNOT1-204ENST00000563130 2280 ntTSL 26.06□□□□□ -1.448e-8■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.858e-8■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 RAI1-203ENST00000471135 570 ntTSL 312.76□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 61.9
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TBRG4Q969Z0 RAD51B-214ENST00000497460 546 ntTSL 43.37□□□□□ -1.871e-6■■■■■ 61.9
TBRG4Q969Z0 RAD51B-213ENST00000492236 417 ntTSL 32.3□□□□□ -2.041e-6■■■■■ 61.9
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TBRG4Q969Z0 UGT2B7-204ENST00000509763 744 ntTSL 54.62□□□□□ -1.679e-7■■■■■ 61.8
TBRG4Q969Z0 AKT1-212ENST00000555380 534 ntTSL 411.55□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 61.8
TBRG4Q969Z0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.296e-9■■■■■ 61.8
TBRG4Q969Z0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.276e-9■■■■■ 61.8
TBRG4Q969Z0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.176e-9■■■■■ 61.8
TBRG4Q969Z0 MRNIP-221ENST00000523267 741 ntTSL 316.07■□□□□ 0.166e-9■■■■■ 61.8
TBRG4Q969Z0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.116e-9■■■■■ 61.8
TBRG4Q969Z0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.046e-9■■■■■ 61.8
TBRG4Q969Z0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -06e-9■■■■■ 61.8
TBRG4Q969Z0 MRNIP-219ENST00000522663 2879 ntTSL 1 (best)12.42□□□□□ -0.426e-9■■■■■ 61.8
TBRG4Q969Z0 PRDM16-207ENST00000512462 3723 ntTSL 1 (best)12.12□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 61.8
TBRG4Q969Z0 MRNIP-204ENST00000518219 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.936e-9■■■■■ 61.8
TBRG4Q969Z0 SUPT3H-205ENST00000475057 1377 ntTSL 27.46□□□□□ -1.217e-8■■■■■ 61.8
TBRG4Q969Z0 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.577e-8■■■■■ 61.8
TBRG4Q969Z0 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.667e-8■■■■■ 61.8
TBRG4Q969Z0 MCF2L-210ENST00000409954 574 ntTSL 514.09□□□□□ -0.157e-7■■■■■ 61.6
TBRG4Q969Z0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 61.5
TBRG4Q969Z0 TOP1-201ENST00000361337 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 61.5
TBRG4Q969Z0 SUPT3H-204ENST00000459689 396 ntTSL 23.65□□□□□ -1.832e-8■■■■■ 61.5
TBRG4Q969Z0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.411e-7■■■■■ 60.8
TBRG4Q969Z0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.044e-13■■■■■ 60.8
TBRG4Q969Z0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.934e-13■■■■■ 60.8
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