Protein–RNA interactions for Protein: Q7L2Z9

CENPQ, Centromere protein Q, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPQQ7L2Z9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPQQ7L2Z9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPQQ7L2Z9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms