Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0Z9

MCMDC2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMDC2Q4G0Z9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCMDC2Q4G0Z9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MCMDC2Q4G0Z9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCMDC2Q4G0Z9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCMDC2Q4G0Z9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCMDC2Q4G0Z9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCMDC2Q4G0Z9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCMDC2Q4G0Z9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCMDC2Q4G0Z9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCMDC2Q4G0Z9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCMDC2Q4G0Z9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCMDC2Q4G0Z9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCMDC2Q4G0Z9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCMDC2Q4G0Z9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCMDC2Q4G0Z9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCMDC2Q4G0Z9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCMDC2Q4G0Z9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCMDC2Q4G0Z9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCMDC2Q4G0Z9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCMDC2Q4G0Z9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCMDC2Q4G0Z9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCMDC2Q4G0Z9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCMDC2Q4G0Z9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCMDC2Q4G0Z9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCMDC2Q4G0Z9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCMDC2Q4G0Z9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms