Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 PEX5-220ENST00000545845 562 ntTSL 416.91■□□□□ 0.35e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 ZDHHC17-207ENST00000549682 596 ntTSL 415.49■□□□□ 0.075e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 STK26-201ENST00000354719 3179 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.065e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 PEX5-202ENST00000266564 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.075e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 ERN1-201ENST00000433197 7876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.455e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 LIMS1-203ENST00000393310 4392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.585e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.35e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 GLMN-202ENST00000463560 734 ntTSL 54.37□□□□□ -1.715e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 ARHGAP21-209ENST00000472150 675 ntTSL 325.85■■□□□ 1.736e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 CENPO-207ENST00000486527 748 ntTSL 224.42■■□□□ 1.52e-6■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 CENPO-209ENST00000498362 761 ntTSL 524.42■■□□□ 1.52e-6■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.332e-6■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 CENPO-208ENST00000491031 1579 ntTSL 219.87■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.656e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 ARHGAP21-211ENST00000476499 1612 ntTSL 218.97■□□□□ 0.636e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 ARHGAP21-207ENST00000446003 3859 ntTSL 1 (best)17.53■□□□□ 0.46e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 SLC25A26-205ENST00000483224 1840 ntTSL 517.37■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 CENPO-206ENST00000473706 4272 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 ARHGAP21-203ENST00000396432 7167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.156e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 CENPO-201ENST00000260662 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 SLC25A26-203ENST00000413054 1096 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 SLC25A26-206ENST00000484768 375 ntTSL 314.26□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 SLC25A26-204ENST00000464350 3879 ntTSL 1 (best)11.53□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.856e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.996e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 CENPO-205ENST00000473476 459 ntTSL 48.56□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 ARHGAP21-204ENST00000416305 801 ntTSL 55.59□□□□□ -1.516e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.36e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.046e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.746e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 ARID1B-235ENST00000638000 1401 ntTSL 512□□□□□ -0.496e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 ARID1B-205ENST00000414678 6528 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.61□□□□□ -0.716e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 ABL1-202ENST00000372348 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.084e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.934e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.444e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 USP3-205ENST00000557884 958 ntTSL 322.28■■□□□ 1.168e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 USP3-221ENST00000561442 542 ntTSL 522.28■■□□□ 1.168e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.568e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 USP3-202ENST00000380324 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.358e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 USP3-216ENST00000559873 584 ntTSL 515.43■□□□□ 0.068e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 USP3-219ENST00000561326 543 ntTSL 415.31■□□□□ 0.048e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 USP3-206ENST00000558157 2439 ntTSL 1 (best)15.13■□□□□ 0.018e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 USP3-217ENST00000560070 545 ntTSL 413.38□□□□□ -0.278e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 USP3-210ENST00000559192 5499 ntTSL 1 (best)9.07□□□□□ -0.968e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 ACSL3-209ENST00000535678 560 ntTSL 332.03■■■□□ 2.722e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 MAP4K4-217ENST00000496989 574 ntTSL 417.21■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.822e-6■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.955e-6■■■■■ 27
HNRNPMP52272 DNAH14-218ENST00000498360 951 ntTSL 321.33■■□□□ 1.015e-6■■■■■ 27
HNRNPMP52272 PSMD13-202ENST00000382671 1489 ntTSL 1 (best)24.77■■□□□ 1.565e-8■■■■■ 27
HNRNPMP52272 PSMD13-213ENST00000533717 670 ntTSL 224.45■■□□□ 1.55e-8■■■■■ 27
HNRNPMP52272 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.385e-8■■■■■ 27
HNRNPMP52272 PSMD13-204ENST00000525665 1632 ntTSL 523.22■■□□□ 1.315e-8■■■■■ 27
HNRNPMP52272 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.225e-8■■■■■ 27
HNRNPMP52272 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.185e-8■■■■■ 27
HNRNPMP52272 PSMD13-208ENST00000528906 858 ntTSL 519.66■□□□□ 0.745e-8■■■■■ 27
HNRNPMP52272 PSMD13-201ENST00000352303 1427 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.715e-8■■■■■ 27
HNRNPMP52272 PSMD13-207ENST00000527982 2200 nt17.28■□□□□ 0.365e-8■■■■■ 27
HNRNPMP52272 PSMD13-205ENST00000526783 892 ntTSL 517.15■□□□□ 0.345e-8■■■■■ 27
HNRNPMP52272 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 27
HNRNPMP52272 NUP214-215ENST00000525980 2274 ntTSL 212.4□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 27
HNRNPMP52272 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.983e-7■■■■■ 27
HNRNPMP52272 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.883e-7■■■■■ 27
HNRNPMP52272 ARID1A-204ENST00000430799 6521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.213e-7■■■■■ 27
HNRNPMP52272 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.012e-7■■■■■ 27
HNRNPMP52272 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.112e-7■■■■■ 27
HNRNPMP52272 CRYL1-203ENST00000480748 1035 ntTSL 320.98■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 27
HNRNPMP52272 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC36.25■■■■□ 3.392e-10■■■■■ 27
HNRNPMP52272 RAB3GAP1-204ENST00000487003 3506 ntTSL 57.84□□□□□ -1.152e-7■■■■■ 27
HNRNPMP52272 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.192e-7■■■■■ 27
HNRNPMP52272 NXN-205ENST00000571338 586 ntTSL 414.13□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 27
HNRNPMP52272 UBAP2L-206ENST00000428595 1419 ntTSL 1 (best)18.56■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 27
HNRNPMP52272 UBAP2L-208ENST00000433615 1789 ntTSL 1 (best)13.66□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 27
HNRNPMP52272 UBAP2L-218ENST00000493867 677 ntTSL 37.83□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 27
HNRNPMP52272 DDX10-201ENST00000322536 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 27
HNRNPMP52272 DDX10-203ENST00000526794 6707 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 27
HNRNPMP52272 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.264e-7■■■■■ 27
HNRNPMP52272 TRAP1-207ENST00000571804 781 ntTSL 536.28■■■■□ 3.44e-7■■■■■ 27
HNRNPMP52272 TRAP1-215ENST00000576106 555 ntTSL 436.03■■■■□ 3.364e-7■■■■■ 27
HNRNPMP52272 TRAP1-203ENST00000570403 521 ntTSL 435.98■■■■□ 3.354e-7■■■■■ 27
HNRNPMP52272 TRAP1-205ENST00000571011 480 ntTSL 534.05■■■■□ 3.044e-7■■■■■ 27
HNRNPMP52272 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.693e-7■■■■■ 27
HNRNPMP52272 TRAP1-211ENST00000574941 558 ntTSL 430.68■■■□□ 2.54e-7■■■■■ 27
HNRNPMP52272 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.83e-7■■■■■ 27
HNRNPMP52272 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 27
HNRNPMP52272 MICAL3-210ENST00000495076 5113 ntTSL 514.09□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 27
HNRNPMP52272 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.855e-7■■■■■ 27
HNRNPMP52272 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.155e-7■■■■■ 27
HNRNPMP52272 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.35e-7■■■■■ 27
HNRNPMP52272 AC010536.2-201ENST00000563036 338 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.124e-7■■■■■ 27
HNRNPMP52272 KLC1-211ENST00000538504 822 ntTSL 236.23■■■■□ 3.393e-8■■■■■ 27
HNRNPMP52272 KLC1-226ENST00000557686 535 ntTSL 334.01■■■■□ 3.033e-8■■■■■ 27
HNRNPMP52272 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.022e-7■■■■■ 27
HNRNPMP52272 SIAH1-207ENST00000568007 2683 ntTSL 1 (best)17.42■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 27
HNRNPMP52272 SIAH1-204ENST00000563745 589 ntTSL 412.8□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 27
HNRNPMP52272 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 27
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 306.8 ms