Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 SLC25A17-206ENST00000427084 749 ntTSL 513.32□□□□□ -0.287e-8■■■■■ 168.9
SF3B1O75533 SLC25A17-210ENST00000435456 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.587e-8■■■■■ 168.9
SF3B1O75533 SLC25A17-213ENST00000449676 533 ntTSL 411.01□□□□□ -0.657e-8■■■■■ 168.9
SF3B1O75533 SLC25A17-204ENST00000420970 1060 ntTSL 510.42□□□□□ -0.747e-8■■■■■ 168.9
SF3B1O75533 SLC25A17-205ENST00000426396 641 ntTSL 510.42□□□□□ -0.747e-8■■■■■ 168.9
SF3B1O75533 SLC25A17-201ENST00000263255 2058 ntTSL 1 (best)9.72□□□□□ -0.857e-8■■■■■ 168.9
SF3B1O75533 SLC25A17-216ENST00000491545 2530 ntTSL 1 (best)9.16□□□□□ -0.947e-8■■■■■ 168.9
SF3B1O75533 SLC25A17-209ENST00000434193 598 ntTSL 49.13□□□□□ -0.957e-8■■■■■ 168.9
SF3B1O75533 SLC25A17-207ENST00000430221 734 ntTSL 48.79□□□□□ -17e-8■■■■■ 168.9
SF3B1O75533 SLC25A17-212ENST00000447566 1243 ntTSL 57.33□□□□□ -1.247e-8■■■■■ 168.9
SF3B1O75533 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 168.7
SF3B1O75533 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 168.7
SF3B1O75533 KBTBD11-OT1-203ENST00000635773 5844 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.28□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 168.7
SF3B1O75533 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 168.7
SF3B1O75533 ARHGEF10-204ENST00000398564 5480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 168.7
SF3B1O75533 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 168.5
SF3B1O75533 PPFIA1-206ENST00000526262 4537 ntTSL 1 (best)9.16□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 168.5
SF3B1O75533 MSI2-215ENST00000582453 496 ntTSL 33.05□□□□□ -1.928e-7■■■■■ 168.3
SF3B1O75533 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 25e-6■■■■■ 168
SF3B1O75533 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.595e-6■■■■■ 168
SF3B1O75533 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.45e-6■■■■■ 168
SF3B1O75533 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.195e-6■■■■■ 168
SF3B1O75533 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.195e-6■■■■■ 168
SF3B1O75533 PCSK6-208ENST00000559417 1035 ntTSL 520.07■□□□□ 0.85e-6■■■■■ 168
SF3B1O75533 ANXA11-204ENST00000437799 610 ntTSL 216.48■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 168
SF3B1O75533 TMOD2-202ENST00000435126 1490 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.76e-7■■■■■ 168
SF3B1O75533 TMOD2-204ENST00000560576 2348 ntTSL 58.36□□□□□ -1.076e-7■■■■■ 168
SF3B1O75533 ASPH-227ENST00000523897 871 ntTSL 38.1□□□□□ -1.111e-7■■■■■ 168
SF3B1O75533 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.166e-7■■■■■ 168
SF3B1O75533 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.436e-7■■■■■ 168
SF3B1O75533 ASPH-229ENST00000524173 587 ntTSL 43.65□□□□□ -1.831e-7■■■■■ 168
SF3B1O75533 ASPH-218ENST00000521499 484 ntTSL 33.37□□□□□ -1.871e-7■■■■■ 168
SF3B1O75533 DOCK8-213ENST00000483757 4788 ntTSL 1 (best)8.36□□□□□ -1.073e-6■■■■■ 167.8
SF3B1O75533 NT5DC1-204ENST00000460749 907 ntTSL 56.9□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 167.8
SF3B1O75533 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.834e-7■■■■■ 167.6
SF3B1O75533 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.044e-7■■■■■ 167.6
SF3B1O75533 USP36-214ENST00000589225 5885 ntTSL 1 (best)14.64□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 167.6
SF3B1O75533 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 167.5
SF3B1O75533 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 167.5
SF3B1O75533 SARS-205ENST00000477544 694 ntTSL 211.35□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 167.5
SF3B1O75533 SLC26A6-222ENST00000496469 1034 ntTSL 513.87□□□□□ -0.193e-7■■■■■ 167.5
SF3B1O75533 ROCK2-201ENST00000261535 1795 ntTSL 523.15■■□□□ 1.33e-6■■■■■ 167.4
SF3B1O75533 SDF4-204ENST00000459994 604 ntTSL 516.94■□□□□ 0.33e-10■■■■■ 167.3
SF3B1O75533 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 167.2
SF3B1O75533 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 167.2
SF3B1O75533 NPRL3-213ENST00000621703 2812 ntTSL 1 (best)16.62■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 167.2
SF3B1O75533 NPRL3-214ENST00000622194 2981 ntTSL 516.37■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 167.2
SF3B1O75533 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 167.2
SF3B1O75533 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.676e-8■■■■■ 167.2
SF3B1O75533 MAN1B1-213ENST00000544448 2090 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.146e-8■■■■■ 167.2
SF3B1O75533 CLHC1-207ENST00000428621 2052 ntTSL 28.35□□□□□ -1.072e-11■■■■■ 167.1
SF3B1O75533 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.232e-11■■■■■ 167.1
SF3B1O75533 CLHC1-208ENST00000451916 616 ntTSL 35.11□□□□□ -1.592e-11■■■■■ 167.1
SF3B1O75533 CLHC1-209ENST00000463300 572 ntTSL 44.76□□□□□ -1.652e-11■■■■■ 167.1
SF3B1O75533 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.652e-11■■■■■ 167.1
SF3B1O75533 CLHC1-212ENST00000487320 594 ntTSL 44.15□□□□□ -1.752e-11■■■■■ 167.1
SF3B1O75533 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.812e-11■■■■■ 167.1
SF3B1O75533 CLHC1-213ENST00000494539 596 ntTSL 42.72□□□□□ -1.972e-11■■■■■ 167.1
SF3B1O75533 CLHC1-210ENST00000464243 509 ntTSL 41.22□□□□□ -2.212e-11■■■■■ 167.1
SF3B1O75533 CLHC1-211ENST00000466020 153 ntTSL 50.36□□□□□ -2.352e-11■■■■■ 167.1
SF3B1O75533 LINC00969-201ENST00000414625 729 ntTSL 517.17■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 167.1
SF3B1O75533 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 167.1
SF3B1O75533 LINC00969-244ENST00000602127 749 ntTSL 515.56■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 167.1
SF3B1O75533 LINC00969-313ENST00000628917 490 ntTSL 515.56■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 167.1
SF3B1O75533 LINC00969-217ENST00000451982 1161 ntTSL 515.06■□□□□ 02e-6■■■■■ 167.1
SF3B1O75533 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 167.1
SF3B1O75533 LINC00969-320ENST00000629823 869 ntTSL 513.18□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 167.1
SF3B1O75533 LINC00969-296ENST00000627718 510 ntTSL 512.42□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 167.1
SF3B1O75533 LINC00969-230ENST00000597034 731 ntTSL 511.31□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 167.1
SF3B1O75533 LINC00969-290ENST00000627502 874 ntTSL 59.19□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 167.1
SF3B1O75533 LINC00969-324ENST00000630243 955 ntTSL 57.72□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 167.1
SF3B1O75533 CHTF18-204ENST00000440239 1801 ntTSL 1 (best)24.89■■□□□ 1.571e-8■■■■■ 167
SF3B1O75533 RAD54L2-205ENST00000487093 4782 ntTSL 510.83□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 167
SF3B1O75533 RAD54L2-201ENST00000409535 9776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 167
SF3B1O75533 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.724e-6■■■■■ 166.8
SF3B1O75533 STX8-211ENST00000575294 454 ntTSL 58.32□□□□□ -1.084e-6■■■■■ 166.8
SF3B1O75533 STX8-212ENST00000575858 638 ntTSL 38.19□□□□□ -1.14e-6■■■■■ 166.8
SF3B1O75533 STX8-209ENST00000574431 731 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.144e-6■■■■■ 166.8
SF3B1O75533 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.66e-7■■■■■ 166.8
SF3B1O75533 DBN1-206ENST00000472831 2667 ntTSL 216.92■□□□□ 0.36e-7■■■■■ 166.8
SF3B1O75533 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.176e-7■■■■■ 166.8
SF3B1O75533 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.036e-7■■■■■ 166.8
SF3B1O75533 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.396e-7■■■■■ 166.7
SF3B1O75533 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.076e-7■■■■■ 166.7
SF3B1O75533 PTOV1-207ENST00000596424 625 ntTSL 220.12■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 166.6
SF3B1O75533 RAPGEF1-206ENST00000438647 588 ntTSL 327.04■■□□□ 1.926e-9■■■■■ 166.6
SF3B1O75533 CSNK1G1-218ENST00000635529 814 ntTSL 520.03■□□□□ 0.82e-7■■■■■ 166.6
SF3B1O75533 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.232e-7■■■■■ 166.6
SF3B1O75533 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 166.6
SF3B1O75533 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 166.6
SF3B1O75533 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 166.6
SF3B1O75533 CSNK1G1-207ENST00000634654 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 166.6
SF3B1O75533 CSNK1G1-201ENST00000303052 8179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 166.6
SF3B1O75533 RALA-202ENST00000434466 768 ntTSL 39.13□□□□□ -0.959e-11■■■■■ 166.6
SF3B1O75533 AC087632.1-203ENST00000634318 1033 ntTSL 56.35□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 166.6
SF3B1O75533 AC087632.1-201ENST00000634251 1973 ntTSL 1 (best)6.24□□□□□ -1.412e-7■■■■■ 166.6
SF3B1O75533 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.412e-7■■■■■ 166.6
SF3B1O75533 AC087632.1-202ENST00000634847 1821 ntTSL 55.63□□□□□ -1.512e-7■■■■■ 166.6
SF3B1O75533 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.711e-7■■■■■ 166.6
SF3B1O75533 RXRA-201ENST00000356384 5770 ntTSL 516.38■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 166.5
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1892.5 ms