Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms