Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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