Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NMUP48645 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NMUP48645 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMUP48645 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMUP48645 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMUP48645 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMUP48645 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMUP48645 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NMUP48645 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMUP48645 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMUP48645 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NMUP48645 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMUP48645 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NMUP48645 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMUP48645 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NMUP48645 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NMUP48645 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NMUP48645 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMUP48645 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NMUP48645 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMUP48645 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMUP48645 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NMUP48645 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NMUP48645 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NMUP48645 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NMUP48645 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMUP48645 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NMUP48645 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NMUP48645 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMUP48645 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NMUP48645 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NMUP48645 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NMUP48645 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NMUP48645 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NMUP48645 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NMUP48645 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NMUP48645 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NMUP48645 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NMUP48645 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NMUP48645 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NMUP48645 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMUP48645 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMUP48645 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMUP48645 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMUP48645 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMUP48645 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMUP48645 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMUP48645 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMUP48645 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMUP48645 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMUP48645 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMUP48645 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMUP48645 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMUP48645 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMUP48645 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMUP48645 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMUP48645 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMUP48645 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMUP48645 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMUP48645 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMUP48645 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMUP48645 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMUP48645 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMUP48645 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMUP48645 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMUP48645 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMUP48645 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMUP48645 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMUP48645 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMUP48645 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMUP48645 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMUP48645 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMUP48645 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NMUP48645 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NMUP48645 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NMUP48645 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NMUP48645 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms