Protein–RNA interactions for Protein: J3QT63

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QT63 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
J3QT63 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QT63 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QT63 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QT63 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QT63 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QT63 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QT63 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QT63 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QT63 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QT63 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QT63 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QT63 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QT63 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QT63 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QT63 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QT63 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QT63 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QT63 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QT63 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QT63 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QT63 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QT63 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QT63 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QT63 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QT63 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QT63 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QT63 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QT63 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QT63 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QT63 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QT63 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QT63 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QT63 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QT63 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QT63 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QT63 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QT63 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QT63 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QT63 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QT63 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QT63 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QT63 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QT63 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QT63 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QT63 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QT63 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QT63 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QT63 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QT63 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QT63 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QT63 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QT63 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QT63 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QT63 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QT63 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QT63 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QT63 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QT63 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QT63 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QT63 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QT63 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QT63 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QT63 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QT63 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QT63 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QT63 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QT63 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QT63 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QT63 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QT63 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QT63 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QT63 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QT63 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QT63 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QT63 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QT63 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QT63 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QT63 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QT63 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QT63 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QT63 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QT63 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QT63 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QT63 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QT63 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QT63 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QT63 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QT63 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QT63 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QT63 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QT63 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QT63 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QT63 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QT63 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QT63 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QT63 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QT63 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QT63 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QT63 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.8 ms