Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L3A6NEY3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms