Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 DNM1-215ENST00000631179 357 ntTSL 38.37□□□□□ -1.073e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SMIM7-201ENST00000358726 850 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.083e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 RCN2-205ENST00000558598 3936 ntTSL 28.25□□□□□ -1.094e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 HAUS8-208ENST00000601564 826 ntTSL 38.16□□□□□ -1.13e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 COA1-204ENST00000415076 1737 ntTSL 38.15□□□□□ -1.113e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 COA1-210ENST00000446330 1520 ntTSL 28.14□□□□□ -1.113e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.134e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 RAD51-206ENST00000527860 566 ntTSL 47.99□□□□□ -1.134e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 AC008764.4-201ENST00000593962 468 ntTSL 27.94□□□□□ -1.143e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 AC008764.4-205ENST00000593459 222 ntAPPRIS P1 TSL 37.92□□□□□ -1.143e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 COA1-211ENST00000446564 1177 ntTSL 27.88□□□□□ -1.153e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SMIM7-212ENST00000594507 430 ntTSL 37.7□□□□□ -1.183e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SMIM7-215ENST00000597781 975 ntTSL 27.51□□□□□ -1.213e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 NAP1L4-218ENST00000530064 625 ntTSL 57.32□□□□□ -1.244e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 AC008764.4-202ENST00000601636 437 ntTSL 37.29□□□□□ -1.243e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.253e-9■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.253e-9■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 AC087380.1-201ENST00000420465 1001 ntTSL 37.08□□□□□ -1.284e-14■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.283e-9■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.293e-9■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SMIM7-203ENST00000461364 601 ntTSL 26.95□□□□□ -1.33e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SMIM7-219ENST00000600740 580 ntTSL 36.89□□□□□ -1.313e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 RBM41-208ENST00000495517 3315 ntTSL 26.79□□□□□ -1.324e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 AARS-206ENST00000569790 528 ntTSL 56.71□□□□□ -1.344e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 WDR48-204ENST00000423296 563 ntTSL 46.7□□□□□ -1.344e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 API5-204ENST00000526394 883 ntTSL 56.28□□□□□ -1.43e-9■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.423e-9■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 AC087380.1-203ENST00000420726 752 ntTSL 56.1□□□□□ -1.434e-14■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 AC008764.4-203ENST00000593991 548 ntTSL 25.96□□□□□ -1.463e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.464e-14■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 PSMC5-218ENST00000584657 576 ntTSL 25.76□□□□□ -1.494e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.524e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SMIM7-210ENST00000593404 1065 ntTSL 25.56□□□□□ -1.523e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 KDM3A-215ENST00000498528 352 ntTSL 35.49□□□□□ -1.534e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 HBE1-203ENST00000396895 578 ntTSL 55.43□□□□□ -1.544e-14■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 ZDHHC17-206ENST00000549010 491 ntTSL 34.87□□□□□ -1.633e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SORT1-207ENST00000493736 583 ntTSL 24.83□□□□□ -1.647e-13■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.643e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.654e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 CSNK1A1-211ENST00000606826 800 ntTSL 54.7□□□□□ -1.663e-9■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 KDM3A-209ENST00000466058 448 ntTSL 44.67□□□□□ -1.664e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 PSME4-203ENST00000461810 562 ntTSL 34.18□□□□□ -1.742e-10■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 PSMA1-205ENST00000527632 693 ntTSL 24.08□□□□□ -1.761e-11■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 CSDE1-212ENST00000529046 571 ntTSL 43.97□□□□□ -1.772e-10■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.783e-9■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 ZDHHC17-211ENST00000550789 686 ntTSL 33.66□□□□□ -1.823e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 API5-209ENST00000532267 337 ntTSL 33.63□□□□□ -1.833e-9■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 IK-202ENST00000502899 690 ntTSL 33.51□□□□□ -1.853e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 DHX15-202ENST00000503562 727 ntTSL 23.1□□□□□ -1.912e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 PSMA1-210ENST00000531023 645 ntTSL 22.99□□□□□ -1.931e-11■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 EIF4G2-230ENST00000534470 520 ntTSL 22.73□□□□□ -1.973e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 EIF4G2-204ENST00000525606 690 ntTSL 22.72□□□□□ -1.973e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 CSDE1-209ENST00000525132 521 ntTSL 52.58□□□□□ -22e-10■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 NAP1L4-205ENST00000455338 352 ntTSL 52.06□□□□□ -2.084e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.865e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 FAXDC2-203ENST00000517448 948 ntTSL 211.67□□□□□ -0.545e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 FAXDC2-205ENST00000517938 1203 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.65e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 FAXDC2-209ENST00000520461 603 ntTSL 410.32□□□□□ -0.765e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 FAXDC2-201ENST00000326080 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.875e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 FAXDC2-202ENST00000423554 3817 ntTSL 28.87□□□□□ -0.995e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 FAXDC2-208ENST00000519501 815 ntTSL 58.24□□□□□ -1.095e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 FAXDC2-206ENST00000518651 536 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.135e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 FAXDC2-212ENST00000521518 575 ntTSL 37.34□□□□□ -1.235e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 FAXDC2-210ENST00000520581 868 ntTSL 47.33□□□□□ -1.245e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.783e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.563e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 KIAA1324L-204ENST00000423294 2911 ntTSL 516.1■□□□□ 0.173e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 KIAA1324L-201ENST00000394714 3073 ntTSL 58.19□□□□□ -1.13e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 KIAA1324L-203ENST00000416314 3179 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.113e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 WDR59-204ENST00000562331 570 ntTSL 410.21□□□□□ -0.774e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 TRIP6-205ENST00000463125 835 ntTSL 216.34■□□□□ 0.214e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 ANLN-208ENST00000446635 829 ntTSL 35.12□□□□□ -1.592e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 RAPGEF5-211ENST00000497668 383 ntTSL 316.19■□□□□ 0.188e-10■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 LUC7L-214ENST00000467552 569 ntTSL 1 (best)15.93■□□□□ 0.143e-13■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.174e-10■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 CCNH-203ENST00000504878 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.584e-10■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 CCNH-202ENST00000504115 778 ntTSL 25.8□□□□□ -1.484e-10■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.764e-10■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 CCNH-209ENST00000511207 451 ntTSL 23.16□□□□□ -1.94e-10■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 CCNH-208ENST00000510921 549 ntTSL 42.66□□□□□ -1.984e-10■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 PDS5A-210ENST00000513798 494 ntTSL 32.24□□□□□ -2.054e-10■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 CCNH-205ENST00000505587 1940 ntTSL 21.68□□□□□ -2.144e-10■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 CNNM3-203ENST00000465224 2607 ntTSL 1 (best)10.37□□□□□ -0.759e-7■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 BTNL9-203ENST00000491209 2199 ntTSL 217.46■□□□□ 0.399e-11■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 WDR59-214ENST00000568323 558 ntTSL 516.07■□□□□ 0.161e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 TMEM259-206ENST00000589055 791 ntTSL 315.05■□□□□ -03e-7■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 TMEM259-212ENST00000607316 477 ntTSL 213.15□□□□□ -0.33e-7■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 GINS1-204ENST00000484893 583 ntTSL 512.75□□□□□ -0.373e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 GINS1-201ENST00000262460 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.933e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 FNBP4-208ENST00000529156 344 ntTSL 33.14□□□□□ -1.915e-9■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SPAG4-202ENST00000430878 453 ntTSL 312.18□□□□□ -0.464e-14■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 RFNG-203ENST00000578356 649 ntTSL 515.35■□□□□ 0.057e-9■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 RFNG-210ENST00000584463 424 ntTSL 313.01□□□□□ -0.337e-9■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 MBNL3-207ENST00000421707 946 ntTSL 511.88□□□□□ -0.517e-9■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 WDR27-212ENST00000546953 3175 ntTSL 211.15□□□□□ -0.627e-9■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 WDR27-204ENST00000464249 302 ntTSL 310.33□□□□□ -0.767e-9■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 HDLBP-228ENST00000459788 563 ntTSL 29.39□□□□□ -0.917e-9■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 ITCH-204ENST00000479215 205 ntTSL 38.24□□□□□ -1.097e-9■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 MBNL3-203ENST00000370849 1444 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.327e-9■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.337e-9■□□□□ 9
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